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Involvement of N4BP2L1, PLEKHA4, and BEGAIN genes in breast cancer and muscle cell development 2024 Dastsooz, Hassan; Anselmi, Francesca; Lauria, Andrea; Cicconetti, Chiara; Proserpio, Valentina; Mohammadisoleimani, Elham; Firoozi, Zahra; Mansoori, Yaser; Haghi-Aminjan, Hamed; Caizzi, Livia; Oliviero, Salvatore
STAT3-dependent long non-coding RNA Lncenc1 contributes to mouse ES cells pluripotency via stabilizing Klf4 mRNA 2024 Monteleone, Emanuele; Corrieri, Paola; Provero, Paolo; Viavattene, Daniele; Pulvirenti, Lorenzo; Raggi, Laura; Carbognin, Elena; Bianchi, Marco E; Martello, Graziano; Oliviero, Salvatore; Pandolfi, Pier Paolo; Poli, Valeria
Gut microbiota depletion delays somatic peripheral nerve development and impairs neuromuscular junction maturation 2024 Cescon M; Gambarotta G; Calabrò S; Cicconetti C; Anselmi F; Kankowski S; Lang L; Basic M; Bleich A; Bolsega S; Steglich M; Oliviero S; Raimondo S; Bizzotto D; Haastert-Talini K; Ronchi G.
Factor VIII promotes angiogenesis and vessel stability regulating extracellular matrix proteins 2024 Olgasi, Cristina; Cucci, Alessia; Molineris, Ivan; Assanelli, Simone; Anselmi, Francesca; Borsotti, Chiara; Sgromo, Chiara; Lauria, Andrea; Merlin, Simone; Walker, Gillian E.; Oliviero, Salvatore; Follenzi, Antonia
SINEUPs to boost translation 2023 Oliviero Salvatore
3plex enables deep computational investigation of triplex forming lncRNAs 2023 Cicconetti, Chiara; Lauria, Andrea; Proserpio, Valentina; Masera, Marco; Tamburrini, Annalaura; Maldotti, Mara; Oliviero, Salvatore; Molineris, Ivan
Tissue memory relies on stem cell priming in distal undamaged areas 2023 Levra Levron, Chiara; Watanabe, Mika; Proserpio, Valentina; Piacenti, Gabriele; Lauria, Andrea; Kaltenbach, Stefan; Tamburrini, Annalaura; Nohara, Takuma; Anselmi, Francesca; Duval, Carlotta; Elettrico, Luca; Donna, Daniela; Conti, Laura; Baev, Denis; Natsuga, Ken; Hagai, Tzachi; Oliviero, Salvatore; Donati, Giacomo
p140Cap inhibits β-Catenin in the breast cancer stem cell compartment instructing a protective anti-tumor immune response 2023 Salemme, Vincenzo; Vedelago, Mauro; Sarcinella, Alessandro; Moietta, Federico; Piccolantonio, Alessio; Moiso, Enrico; Centonze, Giorgia; Manco, Marta; Guala, Andrea; Lamolinara, Alessia; Angelini, Costanza; Morellato, Alessandro; Natalini, Dora; Calogero, Raffaele; Incarnato, Danny; Oliviero, Salvatore; Conti, Laura; Iezzi, Manuela; Tosoni, Daniela; Bertalot, Giovanni; Freddi, Stefano; Tucci, Francesco A; De Sanctis, Francesco; Frusteri, Cristina; Ugel, Stefano; Bronte, Vincenzo; Cavallo, Federica; Provero, Paolo; Gai, Marta; Taverna, Daniela; Turco, Emilia; Pece, Salvatore; Defilippi, Paola
FK506 bypasses the effect of erythroferrone in cancer cachexia skeletal muscle atrophy 2023 Erica Mina, Elisabeth Wyart, Roberta Sartori, Elia Angelino, Ivan Zaggia, Valentina Rausch, Mara Maldotti, Alessia Pagani, Myriam Y. Hsu, Alberto Friziero, Cosimo Sperti, Alessio Menga, Andrea Graziani, Emilio Hirsch, Salvatore Oliviero, Marco Sandri, Laura Conti, Léon Kautz, Laura Silvestri, Paolo E. Porporato
FK506 bypasses the effect of erythroferrone in cancer cachexia skeletal muscle atrophy 2023 Erica Mina, Elisabeth Wyart, Roberta Sartori, Elia Angelino, Ivan Zaggia, Valentina Rausch, Mara Maldotti, Alessia Pagani, Myriam Y. Hsu, Alberto Friziero, Cosimo Sperti, Alessio Menga, Andrea Graziani, Emilio Hirsch, Salvatore Oliviero, Marco Sandri, Laura Conti, Léon Kautz, Laura Silvestri, Paolo E. Porporato
DNMT3B supports meso-endoderm differentiation from mouse embryonic stem cells 2023 Lauria, Andrea; Meng, Guohua; Proserpio, Valentina; Rapelli, Stefania; Maldotti, Mara; Polignano, Isabelle Laurence; Anselmi, Francesca; Incarnato, Danny; Krepelova, Anna; Donna, Daniela; Levra Levron, Chiara; Donati, Giacomo; Molineris, Ivan; Neri, Francesco; Oliviero, Salvatore
IFNγ-Stat1 axis drives aging-associated loss of intestinal tissue homeostasis and regeneration 2023 Omrani, Omid; Krepelova, Anna; Rasa, Seyed Mohammad Mahdi; Sirvinskas, Dovydas; Lu, Jing; Annunziata, Francesco; Garside, George; Bajwa, Seerat; Reinhardt, Susanne; Adam, Lisa; Käppel, Sandra; Ducano, Nadia; Donna, Daniela; Ori, Alessandro; Oliviero, Salvatore; Rudolph, Karl Lenhard; Neri, Francesco
NR2F1 shapes mitochondria in the mouse brain, providing new insights into Bosch-Boonstra-Schaaf optic atrophy syndrome 2023 Bonzano S; Dallorto E; Molineris I; Michelon F; Crisci I; Gambarotta G; Neri F; Oliviero S; Beckervordersandforth R; Lie DC; Peretto P; Bovetti S; Studer M; De Marchis S
The acetyltransferase p300 is recruited in trans to multiple enhancer sites by lncSmad7 2022 Mara Maldotti , Andrea Lauria, Francesca Anselmi , Ivan Molineris, Annalaura Tamburrini, Guohua Meng, Isabelle Laurence Polignano , Mirko Giuseppe Scrivano, Fabiola Campestre, Lisa Marie Simon, Stefania Rapelli, Edoardo Morandi, Danny Incarnato, Salvatore Oliviero
The TFEB-TGIF1 axis regulates EMT in mouse epicardial cells 2022 Astanina, Elena; Doronzo, Gabriella; Corà, Davide; Neri, Francesco; Oliviero, Salvatore; Genova, Tullio; Mussano, Federico; Middonti, Emanuele; Vallariello, Edoardo; Cencioni, Chiara; Valdembri, Donatella; Serini, Guido; Limana, Federica; Foglio, Eleonora; Ballabio, Andrea; Bussolino, Federico
The Emerging Roles of Long Non-Coding RNAs in Intellectual Disability and Related Neurodevelopmental Disorders 2022 Carla Liaci, Lucia Prandi, Lisa Pavinato, Alfredo Brusco, Mara Maldotti, Ivan Molineris, Salvatore Oliviero, Giorgio R. Merlo
Dihydroorotate dehydrogenase inhibition reveals metabolic vulnerability in chronic myeloid leukemia 2022 Houshmand, Mohammad; Vitale, Nicoletta; Orso, Francesca; Cignetti, Alessandro; Molineris, Ivan; Gaidano, Valentina; Sainas, Stefano; Giorgis, Marta; Boschi, Donatella; Fava, Carmen; Passoni, Alice; Gai, Marta; Geuna, Massimo; Sora, Federica; Iurlo, Alessandra; Abruzzese, Elisabetta; Breccia, Massimo; Mulas, Olga; Caocci, Giovanni; Castagnetti, Fausto; Taverna, Daniela; Oliviero, Salvatore; Pane, Fabrizio; Lolli, Marco Lucio; Circosta, Paola; Saglio, Giuseppe
STAT3 induces breast cancer growth via ANGPTL4, MMP13 and STC1 secretion by cancer associated fibroblasts 2022 Avalle L.; Raggi L.; Monteleone E.; Savino A.; Viavattene D.; Statello L.; Camperi A.; Stabile S.A.; Salemme V.; De Marzo N.; Marino F.; Guglielmi C.; Lobascio A.; Zanini C.; Forni M.; Incarnato D.; Defilippi P.; Oliviero S.; Poli V.
FOXA1 regulates alternative splicing in prostate cancer 2022 Del Giudice, Marco; Foster, John G; Peirone, Serena; Rissone, Alberto; Caizzi, Livia; Gaudino, Federica; Parlato, Caterina; Anselmi, Francesca; Arkell, Rebecca; Guarrera, Simonetta; Oliviero, Salvatore; Basso, Giuseppe; Rajan, Prabhakar; Cereda, Matteo
SNAI1 is upregulated during muscle regeneration and represses FGF21 and ATF3 expression by directly binding their promoters 2022 Elia, Ines; Realini, Giulia; Di Mauro, Vittoria; Borghi, Sara; Bottoni, Laura; Tornambè, Salvatore; Vitiello, Libero; Weiss, Stephen J; Chiariello, Mario; Tamburrini, Annalaura; Oliviero, Salvatore; Neri, Francesco; Orlandini, Maurizio; Galvagni, Federico
Genome-wide analysis of smad7-mediated transcription in mouse embryonic stem cells 2021 Meng G.; Lauria A.; Maldotti M.; Anselmi F.; Polignano I.L.; Rapelli S.; Donna D.; Oliviero S.
Flow Cytometry for Beginners: Hints and Tips for Approaching the Very First Single-Cell Technique 2021 Proserpio V.; Conti L.; Oliviero S.
Single-Cell Sequencing for Everybody 2021 Proserpio, Valentina; Duval, Carlotta; Falvo, Vanessa; Donati, Giacomo; Oliviero, Salvatore
Expression and Function of C1orf132 Long-Noncoding RNA in Breast Cancer Cell Lines and Tissues 2021 Afsaneh Malekzadeh Shafaroudi, Ali Sharifi-Zarchi, Saeid Rahmani, Nahid Nafissi, Seyed Javad Mowla, Andrea Lauria, Salvatore Oliviero, Maryam M Matin
Long Noncoding RNAs in Human Stemness and Differentiation 2021 Mirzadeh Azad F.; Polignano I.L.; Proserpio V.; Oliviero S.
Hair follicle stem cell progeny heal blisters while pausing skin development 2021 Fujimura Y.; Watanabe M.; Ohno K.; Kobayashi Y.; Takashima S.; Nakamura H.; Kosumi H.; Wang Y.; Mai Y.; Lauria A.; Proserpio V.; Ujiie H.; Iwata H.; Nishie W.; Nagayama M.; Oliviero S.; Donati G.; Shimizu H.; Natsuga K.
HNRNPM controls circRNA biogenesis and splicing fidelity to sustain cancer cell fitness 2021 Ho, Jessica SY; Di Tullio, Federico; Schwarz, Megan; Low, Diana; Incarnato, Danny; Gay, Florence; Tabaglio, Tommaso; Zhang, JingXian; Wollmann, Heike; Chen, Leilei; An, Omer; Chan, Tim Hon Man; Hall Hickman, Alexander; Zheng, Simin; Roudko, Vladimir; Chen, Sujun; Karz, Alcida; Ahmed, Musaddeque; He, Housheng Hansen; Greenbaum, Benjamin D; Oliviero, Salvatore; Serresi, Michela; Gargiulo, Gaetano; Mann, Karen M; Hernando, Eva; Mulholland, David; Marazzi, Ivan; Wee, Dave Keng Boon; Guccione, Ernesto
Genome-scale deconvolution of RNA structure ensembles 2021 Edoardo Morandi, Ilaria Manfredonia, Lisa M. Simon, Francesca Anselmi, Martijn J. van Hemert, Salvatore Oliviero, Danny Incarnato,
Metabolic control of DNA methylation in naive pluripotent cells 2021 Riccardo M. Betto, Linda Diamante, Valentina Perrera, Matteo Audano, Stefania Rapelli, Andrea Lauria , Danny Incarnato, Mattia Arboit, Silvia Pedretti, Giovanni Rigoni, Vincent Guerineau, David Touboul, Giuliano Giuseppe Stirparo, Tim Lohoff, Thorsten Boroviak, Paolo Grumati, Maria E. Soriano, Jennifer Nichols, Nico Mitro, Salvatore Oliviero, Graziano Martello
Molecular dynamics of targeting CD38 in multiple myeloma 2021 Malavasi F.; Faini A.C.; Morandi F.; Castella B.; Incarnato D.; Oliviero S.; Horenstein A.L.; Massaia M.; van de Donk N.W.C.J.; Richardson P.G.
NR2F1 regulates regional progenitor dynamics in the mouse neocortex and cortical gyrification in BBSOAS patients 2020 Bertacchi M.; Romano A.L.; Loubat A.; Tran Mau-Them F.; Willems M.; Faivre L.; Khau van Kien P.; Perrin L.; Devillard F.; Sorlin A.; Kuentz P.; Philippe C.; Garde A.; Neri F.; Di Giaimo R.; Oliviero S.; Cappello S.; D'Incerti L.; Frassoni C.; Studer M.
Modulation of circRNA Metabolism by m6A Modification 2020 Di Timoteo G.; Dattilo D.; Centron-Broco A.; Colantoni A.; Guarnacci M.; Rossi F.; Incarnato D.; Oliviero S.; Fatica A.; Morlando M.; Bozzoni I.
The transcriptional regulator ZNF398 mediates pluripotency and epithelial character downstream of TGF-beta in human PSCs 2020 Zorzan I.; Pellegrini M.; Arboit M.; Incarnato D.; Maldotti M.; Forcato M.; Tagliazucchi G.M.; Carbognin E.; Montagner M.; Oliviero S.; Martello G.
Identification of altered biological processes in heterogeneous RNA-sequencing data by discretization of expression profiles 2020 Andrea Lauria, Serena Peirone, Marco Del Giudice, Francesca Priante, Prabhakar Rajan, Michele Caselle, Salvatore Oliviero, Matteo Cereda
TFEB controls vascular development by regulating the proliferation of endothelial cells 2019 Doronzo, Gabriella; Astanina, Elena; Corà, Davide; Chiabotto, Giulia; Comunanza, Valentina; Noghero, Alessio; Neri, Francesco; Puliafito, Alberto; Primo, Luca; Spampanato, Carmine; Settembre, Carmine; Ballabio, Andrea; Camussi, Giovanni; Oliviero, Salvatore; Bussolino, Federico
Extracellular nicotinate phosphoribosyltransferasebinds Toll like receptor 4 and mediatesinflammation 2019 Antonella Managò, Valentina Audrito, Francesca Mazzola, Leonardo Sorci, Federica Gaudino, Katiuscia Gizzi, Nicoletta Vitale, Danny Incarnato, Gabriele Minazzato, Alice Ianniello, Antonio Varriale,Sabato D’Auria, Giulio Mengozzi, Gianfranco Politano, Salvatore Oliviero, Nadia Raffaelli, Silvia Deaglio
A Comprehensive Bioinformatics Analysis of UBE2C in Cancers 2019 Dastsooz H.; Cereda M.; Donna D.; Oliviero S.
HaTSPiL: A modular pipeline for high throughput sequencing data analysis 2019 Morandi E.; Cereda M.; Incarnato D.; Parlato C.; Basile G.; Anselmi F.; Lauria A.; Simon L.M.; Polignano I.L.; Arruga F.; Deaglio S.; Tirtei E.; Fagioli F.; Oliviero S.
Choice of alternative polyadenylation sites, mediated by the rna-binding protein Elavl3, plays a role in differentiation of inhibitory neuronal progenitors 2019 Grassi E.; Santoro R.; Umbach A.; Grosso A.; Oliviero S.; Neri F.; Conti L.; Ala U.; Provero P.; Dicunto F.; Merlo G.R.
In vivo analysis of influenza A mRNA secondary structures identifies critical regulatory motifs 2019 Simon, Lisa Marie; Morandi, Edoardo; Luganini, Anna; Gribaudo, Giorgio; Martinez-Sobrido, Luis; Turner, Douglas H; Oliviero, Salvatore; Incarnato, Danny
Role of CD133 Molecule in Wnt Response and Renal Repair 2018 Brossa, Alessia; Papadimitriou, Elli; Collino, Federica; Incarnato, Danny; Oliviero, Salvatore; Camussi, Giovanni; Bussolati, Benedetta*
RNA framework: An all-in-one toolkit for the analysis of RNA structures and post-transcriptional modifications 2018 Incarnato D.; Morandi E.; Simon L.M.; Oliviero S.
SiO2 nanoparticles modulate the electrical activity of neuroendocrine cells without exerting genomic effects 2018 Distasi, C.; Ruffinatti, F. A.; M., Dionisi; Antoniotti, S.; Gilardino, A.; Croci, G.; Riva, B.; Bassino, E.; Alberto, G.; Castroflorio, E.; Incarnato, D.; Morandi, E.; Martra, G.; Oliviero, S.; Munaron, L.; Lovisolo, D.
Mutations in NOTCH1 PEST-domain orchestrate CCL19-driven homing of Chronic Lymphocytic Leukemia cells by modulating the tumor suppressor gene DUSP22 2017 Francesca, Arruga; Branimir, Gizdic; Bologna, Cinzia; Cignetto, Simona; Buonincontri, Roberta; Serra, Sara; Vaisitti, Tiziana; Katiuscia, Gizzi; Vitale, Nicoletta; Garaffo, Giulia; Mereu, Elisabetta; Fary, Diop; Francesco, Neri; Coscia, Marta; John, Allan; Piva, Roberto; Oliviero, Salvatore; Richard, Furman; Davide, Rossi; Gianluca, Gaidano; Deaglio, Silvia
MicroRNAs-143 and -145 induce epithelial to mesenchymal transition and modulate the expression of junction proteins 2017 Avalle, Lidia; Incarnato, Danny; Savino, Aurora; Gai, Marta; Marino, Francesca; Pensa, Sara; Barbieri, Isaia; Stadler, Michael B; Provero, Paolo; Oliviero, Salvatore; Poli, Valeria
PD-L1 up-regulation in melanoma increases disease aggressiveness and is mediated through miR-17-5p 2017 Audrito, Valentina; Serra, Sara; Stingi, Aureliano; Orso, Francesca; Gaudino, Federica; Bologna, Cinzia; Neri, Francesco; Garaffo, Giulia; Nassini, Romina; Baroni, Gianna; Rulli, Eliana; Massi, Daniela; Oliviero, Salvatore; Piva, Roberto; Taverna, Daniela; Mandalà, Mario; Deaglio, Silvia
Rictor/mTORC2 deficiency enhances keratinocyte stress tolerance via mitohormesis. 2017 Beatrice, Tassone; Stefania, Saoncella; Francesco, Neri; Ugo, Ala; Davide, Brusa; Magnuson Mark, A; Paolo, Provero; Salvatore, Oliviero; Chiara, Riganti; Enzo, Calautti
High-throughput single-base resolution mapping of RNA 2-O-methylated residues 2017 Incarnato D.; Anselmi F.; Morandi E.; Neri F.; Maldotti M.; Rapelli S.; Parlato C.; Basile G.; Oliviero S.
In vivo probing of nascent RNA structures reveals principles of cotranscriptional folding 2017 Incarnato D.; Morandi E.; Anselmi F.; Simon L.M.; Basile G.; Oliviero S.
The RNA Epistructurome: Uncovering RNA Function by Studying Structure and Post-Transcriptional Modifications 2017 Incarnato, Danny; Oliviero, Salvatore
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