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FK506 bypasses the effect of erythroferrone in cancer cachexia skeletal muscle atrophy 2023 Erica Mina, Elisabeth Wyart, Roberta Sartori, Elia Angelino, Ivan Zaggia, Valentina Rausch, Mara Maldotti, Alessia Pagani, Myriam Y. Hsu, Alberto Friziero, Cosimo Sperti, Alessio Menga, Andrea Graziani, Emilio Hirsch, Salvatore Oliviero, Marco Sandri, Laura Conti, Léon Kautz, Laura Silvestri, Paolo E. Porporato
Tissue memory relies on stem cell priming in distal undamaged areas 2023 Levra Levron, Chiara; Watanabe, Mika; Proserpio, Valentina; Piacenti, Gabriele; Lauria, Andrea; Kaltenbach, Stefan; Tamburrini, Annalaura; Nohara, Takuma; Anselmi, Francesca; Duval, Carlotta; Elettrico, Luca; Donna, Daniela; Conti, Laura; Baev, Denis; Natsuga, Ken; Hagai, Tzachi; Oliviero, Salvatore; Donati, Giacomo
IFNγ-Stat1 axis drives aging-associated loss of intestinal tissue homeostasis and regeneration 2023 Omrani, Omid; Krepelova, Anna; Rasa, Seyed Mohammad Mahdi; Sirvinskas, Dovydas; Lu, Jing; Annunziata, Francesco; Garside, George; Bajwa, Seerat; Reinhardt, Susanne; Adam, Lisa; Käppel, Sandra; Ducano, Nadia; Donna, Daniela; Ori, Alessandro; Oliviero, Salvatore; Rudolph, Karl Lenhard; Neri, Francesco
3plex enables deep computational investigation of triplex forming lncRNAs 2023 Cicconetti, Chiara; Lauria, Andrea; Proserpio, Valentina; Masera, Marco; Tamburrini, Annalaura; Maldotti, Mara; Oliviero, Salvatore; Molineris, Ivan
DNMT3B supports meso-endoderm differentiation from mouse embryonic stem cells 2023 Lauria, Andrea; Meng, Guohua; Proserpio, Valentina; Rapelli, Stefania; Maldotti, Mara; Polignano, Isabelle Laurence; Anselmi, Francesca; Incarnato, Danny; Krepelova, Anna; Donna, Daniela; Levra Levron, Chiara; Donati, Giacomo; Molineris, Ivan; Neri, Francesco; Oliviero, Salvatore
NR2F1 shapes mitochondria in the mouse brain, providing new insights into Bosch-Boonstra-Schaaf optic atrophy syndrome 2023 Bonzano S; Dallorto E; Molineris I; Michelon F; Crisci I; Gambarotta G; Neri F; Oliviero S; Beckervordersandforth R; Lie DC; Peretto P; Bovetti S; Studer M; De Marchis S
SINEUPs to boost translation 2023 Oliviero Salvatore
p140Cap inhibits β-Catenin in the breast cancer stem cell compartment instructing a protective anti-tumor immune response 2023 Salemme, Vincenzo; Vedelago, Mauro; Sarcinella, Alessandro; Moietta, Federico; Piccolantonio, Alessio; Moiso, Enrico; Centonze, Giorgia; Manco, Marta; Guala, Andrea; Lamolinara, Alessia; Angelini, Costanza; Morellato, Alessandro; Natalini, Dora; Calogero, Raffaele; Incarnato, Danny; Oliviero, Salvatore; Conti, Laura; Iezzi, Manuela; Tosoni, Daniela; Bertalot, Giovanni; Freddi, Stefano; Tucci, Francesco A; De Sanctis, Francesco; Frusteri, Cristina; Ugel, Stefano; Bronte, Vincenzo; Cavallo, Federica; Provero, Paolo; Gai, Marta; Taverna, Daniela; Turco, Emilia; Pece, Salvatore; Defilippi, Paola
The Emerging Roles of Long Non-Coding RNAs in Intellectual Disability and Related Neurodevelopmental Disorders 2022 Carla Liaci, Lucia Prandi, Lisa Pavinato, Alfredo Brusco, Mara Maldotti, Ivan Molineris, Salvatore Oliviero, Giorgio R. Merlo
SNAI1 is upregulated during muscle regeneration and represses FGF21 and ATF3 expression by directly binding their promoters 2022 Elia, Ines; Realini, Giulia; Di Mauro, Vittoria; Borghi, Sara; Bottoni, Laura; Tornambè, Salvatore; Vitiello, Libero; Weiss, Stephen J; Chiariello, Mario; Tamburrini, Annalaura; Oliviero, Salvatore; Neri, Francesco; Orlandini, Maurizio; Galvagni, Federico
STAT3 induces breast cancer growth via ANGPTL4, MMP13 and STC1 secretion by cancer associated fibroblasts 2022 Avalle L.; Raggi L.; Monteleone E.; Savino A.; Viavattene D.; Statello L.; Camperi A.; Stabile S.A.; Salemme V.; De Marzo N.; Marino F.; Guglielmi C.; Lobascio A.; Zanini C.; Forni M.; Incarnato D.; Defilippi P.; Oliviero S.; Poli V.
Dihydroorotate dehydrogenase inhibition reveals metabolic vulnerability in chronic myeloid leukemia 2022 Houshmand, Mohammad; Vitale, Nicoletta; Orso, Francesca; Cignetti, Alessandro; Molineris, Ivan; Gaidano, Valentina; Sainas, Stefano; Giorgis, Marta; Boschi, Donatella; Fava, Carmen; Passoni, Alice; Gai, Marta; Geuna, Massimo; Sora, Federica; Iurlo, Alessandra; Abruzzese, Elisabetta; Breccia, Massimo; Mulas, Olga; Caocci, Giovanni; Castagnetti, Fausto; Taverna, Daniela; Oliviero, Salvatore; Pane, Fabrizio; Lolli, Marco Lucio; Circosta, Paola; Saglio, Giuseppe
FOXA1 regulates alternative splicing in prostate cancer 2022 Del Giudice, Marco; Foster, John G; Peirone, Serena; Rissone, Alberto; Caizzi, Livia; Gaudino, Federica; Parlato, Caterina; Anselmi, Francesca; Arkell, Rebecca; Guarrera, Simonetta; Oliviero, Salvatore; Basso, Giuseppe; Rajan, Prabhakar; Cereda, Matteo
The TFEB-TGIF1 axis regulates EMT in mouse epicardial cells 2022 Astanina, Elena; Doronzo, Gabriella; Corà, Davide; Neri, Francesco; Oliviero, Salvatore; Genova, Tullio; Mussano, Federico; Middonti, Emanuele; Vallariello, Edoardo; Cencioni, Chiara; Valdembri, Donatella; Serini, Guido; Limana, Federica; Foglio, Eleonora; Ballabio, Andrea; Bussolino, Federico
The acetyltransferase p300 is recruited in trans to multiple enhancer sites by lncSmad7 2022 Mara Maldotti , Andrea Lauria, Francesca Anselmi , Ivan Molineris, Annalaura Tamburrini, Guohua Meng, Isabelle Laurence Polignano , Mirko Giuseppe Scrivano, Fabiola Campestre, Lisa Marie Simon, Stefania Rapelli, Edoardo Morandi, Danny Incarnato, Salvatore Oliviero
Hair follicle stem cell progeny heal blisters while pausing skin development 2021 Fujimura Y.; Watanabe M.; Ohno K.; Kobayashi Y.; Takashima S.; Nakamura H.; Kosumi H.; Wang Y.; Mai Y.; Lauria A.; Proserpio V.; Ujiie H.; Iwata H.; Nishie W.; Nagayama M.; Oliviero S.; Donati G.; Shimizu H.; Natsuga K.
Genome-scale deconvolution of RNA structure ensembles 2021 Edoardo Morandi, Ilaria Manfredonia, Lisa M. Simon, Francesca Anselmi, Martijn J. van Hemert, Salvatore Oliviero, Danny Incarnato,
Molecular dynamics of targeting CD38 in multiple myeloma 2021 Malavasi F.; Faini A.C.; Morandi F.; Castella B.; Incarnato D.; Oliviero S.; Horenstein A.L.; Massaia M.; van de Donk N.W.C.J.; Richardson P.G.
Single-Cell Sequencing for Everybody 2021 Proserpio, Valentina; Duval, Carlotta; Falvo, Vanessa; Donati, Giacomo; Oliviero, Salvatore
HNRNPM controls circRNA biogenesis and splicing fidelity to sustain cancer cell fitness 2021 Ho, Jessica SY; Di Tullio, Federico; Schwarz, Megan; Low, Diana; Incarnato, Danny; Gay, Florence; Tabaglio, Tommaso; Zhang, JingXian; Wollmann, Heike; Chen, Leilei; An, Omer; Chan, Tim Hon Man; Hall Hickman, Alexander; Zheng, Simin; Roudko, Vladimir; Chen, Sujun; Karz, Alcida; Ahmed, Musaddeque; He, Housheng Hansen; Greenbaum, Benjamin D; Oliviero, Salvatore; Serresi, Michela; Gargiulo, Gaetano; Mann, Karen M; Hernando, Eva; Mulholland, David; Marazzi, Ivan; Wee, Dave Keng Boon; Guccione, Ernesto
Long Noncoding RNAs in Human Stemness and Differentiation 2021 Mirzadeh Azad F.; Polignano I.L.; Proserpio V.; Oliviero S.
Metabolic control of DNA methylation in naive pluripotent cells 2021 Riccardo M. Betto, Linda Diamante, Valentina Perrera, Matteo Audano, Stefania Rapelli, Andrea Lauria , Danny Incarnato, Mattia Arboit, Silvia Pedretti, Giovanni Rigoni, Vincent Guerineau, David Touboul, Giuliano Giuseppe Stirparo, Tim Lohoff, Thorsten Boroviak, Paolo Grumati, Maria E. Soriano, Jennifer Nichols, Nico Mitro, Salvatore Oliviero, Graziano Martello
Flow Cytometry for Beginners: Hints and Tips for Approaching the Very First Single-Cell Technique 2021 Proserpio V.; Conti L.; Oliviero S.
Expression and Function of C1orf132 Long-Noncoding RNA in Breast Cancer Cell Lines and Tissues 2021 Afsaneh Malekzadeh Shafaroudi, Ali Sharifi-Zarchi, Saeid Rahmani, Nahid Nafissi, Seyed Javad Mowla, Andrea Lauria, Salvatore Oliviero, Maryam M Matin
Genome-wide analysis of smad7-mediated transcription in mouse embryonic stem cells 2021 Meng G.; Lauria A.; Maldotti M.; Anselmi F.; Polignano I.L.; Rapelli S.; Donna D.; Oliviero S.
Modulation of circRNA Metabolism by m6A Modification 2020 Di Timoteo G.; Dattilo D.; Centron-Broco A.; Colantoni A.; Guarnacci M.; Rossi F.; Incarnato D.; Oliviero S.; Fatica A.; Morlando M.; Bozzoni I.
NR2F1 regulates regional progenitor dynamics in the mouse neocortex and cortical gyrification in BBSOAS patients 2020 Bertacchi M.; Romano A.L.; Loubat A.; Tran Mau-Them F.; Willems M.; Faivre L.; Khau van Kien P.; Perrin L.; Devillard F.; Sorlin A.; Kuentz P.; Philippe C.; Garde A.; Neri F.; Di Giaimo R.; Oliviero S.; Cappello S.; D'Incerti L.; Frassoni C.; Studer M.
The transcriptional regulator ZNF398 mediates pluripotency and epithelial character downstream of TGF-beta in human PSCs 2020 Zorzan I.; Pellegrini M.; Arboit M.; Incarnato D.; Maldotti M.; Forcato M.; Tagliazucchi G.M.; Carbognin E.; Montagner M.; Oliviero S.; Martello G.
Identification of altered biological processes in heterogeneous RNA-sequencing data by discretization of expression profiles 2020 Andrea Lauria, Serena Peirone, Marco Del Giudice, Francesca Priante, Prabhakar Rajan, Michele Caselle, Salvatore Oliviero, Matteo Cereda
In vivo analysis of influenza A mRNA secondary structures identifies critical regulatory motifs 2019 Simon, Lisa Marie; Morandi, Edoardo; Luganini, Anna; Gribaudo, Giorgio; Martinez-Sobrido, Luis; Turner, Douglas H; Oliviero, Salvatore; Incarnato, Danny
TFEB controls vascular development by regulating the proliferation of endothelial cells 2019 Doronzo, Gabriella; Astanina, Elena; Corà, Davide; Chiabotto, Giulia; Comunanza, Valentina; Noghero, Alessio; Neri, Francesco; Puliafito, Alberto; Primo, Luca; Spampanato, Carmine; Settembre, Carmine; Ballabio, Andrea; Camussi, Giovanni; Oliviero, Salvatore; Bussolino, Federico
A Comprehensive Bioinformatics Analysis of UBE2C in Cancers 2019 Dastsooz H.; Cereda M.; Donna D.; Oliviero S.
Extracellular nicotinate phosphoribosyltransferasebinds Toll like receptor 4 and mediatesinflammation 2019 Antonella Managò, Valentina Audrito, Francesca Mazzola, Leonardo Sorci, Federica Gaudino, Katiuscia Gizzi, Nicoletta Vitale, Danny Incarnato, Gabriele Minazzato, Alice Ianniello, Antonio Varriale,Sabato D’Auria, Giulio Mengozzi, Gianfranco Politano, Salvatore Oliviero, Nadia Raffaelli, Silvia Deaglio
Choice of alternative polyadenylation sites, mediated by the rna-binding protein Elavl3, plays a role in differentiation of inhibitory neuronal progenitors 2019 Grassi E.; Santoro R.; Umbach A.; Grosso A.; Oliviero S.; Neri F.; Conti L.; Ala U.; Provero P.; Dicunto F.; Merlo G.R.
HaTSPiL: A modular pipeline for high throughput sequencing data analysis 2019 Morandi E.; Cereda M.; Incarnato D.; Parlato C.; Basile G.; Anselmi F.; Lauria A.; Simon L.M.; Polignano I.L.; Arruga F.; Deaglio S.; Tirtei E.; Fagioli F.; Oliviero S.
RNA framework: An all-in-one toolkit for the analysis of RNA structures and post-transcriptional modifications 2018 Incarnato D.; Morandi E.; Simon L.M.; Oliviero S.
Role of CD133 Molecule in Wnt Response and Renal Repair 2018 Brossa, Alessia; Papadimitriou, Elli; Collino, Federica; Incarnato, Danny; Oliviero, Salvatore; Camussi, Giovanni; Bussolati, Benedetta*
SiO2 nanoparticles modulate the electrical activity of neuroendocrine cells without exerting genomic effects 2018 Distasi, C.; Ruffinatti, F. A.; M., Dionisi; Antoniotti, S.; Gilardino, A.; Croci, G.; Riva, B.; Bassino, E.; Alberto, G.; Castroflorio, E.; Incarnato, D.; Morandi, E.; Martra, G.; Oliviero, S.; Munaron, L.; Lovisolo, D.
Mutations in NOTCH1 PEST-domain orchestrate CCL19-driven homing of Chronic Lymphocytic Leukemia cells by modulating the tumor suppressor gene DUSP22 2017 Francesca, Arruga; Branimir, Gizdic; Bologna, Cinzia; Cignetto, Simona; Buonincontri, Roberta; Serra, Sara; Vaisitti, Tiziana; Katiuscia, Gizzi; Vitale, Nicoletta; Garaffo, Giulia; Mereu, Elisabetta; Fary, Diop; Francesco, Neri; Coscia, Marta; John, Allan; Piva, Roberto; Oliviero, Salvatore; Richard, Furman; Davide, Rossi; Gianluca, Gaidano; Deaglio, Silvia
High-throughput single-base resolution mapping of RNA 2-O-methylated residues 2017 Incarnato D.; Anselmi F.; Morandi E.; Neri F.; Maldotti M.; Rapelli S.; Parlato C.; Basile G.; Oliviero S.
Intragenic DNA methylation prevents spurious transcription initiation. 2017 Neri, F; Rapelli, S; Krepelova, A; Incarnato, D; Parlato, C; Basile, G; Maldotti, M; Anselmi, F; Oliviero, S.
The RNA Epistructurome: Uncovering RNA Function by Studying Structure and Post-Transcriptional Modifications 2017 Incarnato, Danny; Oliviero, Salvatore
PD-L1 up-regulation in melanoma increases disease aggressiveness and is mediated through miR-17-5p 2017 Audrito, Valentina; Serra, Sara; Stingi, Aureliano; Orso, Francesca; Gaudino, Federica; Bologna, Cinzia; Neri, Francesco; Garaffo, Giulia; Nassini, Romina; Baroni, Gianna; Rulli, Eliana; Massi, Daniela; Oliviero, Salvatore; Piva, Roberto; Taverna, Daniela; Mandalà, Mario; Deaglio, Silvia
Citron Kinase Deficiency Leads to Chromosomal Instability and TP53-Sensitive Microcephaly 2017 Bianchi, Federico Tommaso; Tocco, Chiara; Pallavicini, Gianmarco; Liu, Yifan; Vernì, Fiammetta; Merigliano, Chiara; Bonaccorsi, Silvia; El-Assawy, Nadia; Priano, Lorenzo; Gai, Marta; Berto, Gaia Elena; Chiotto, Alessandra Maria Adelaide; Sgrò, Francesco; Caramello, Alessia; Tasca, Laura; Ala, Ugo; Neri, Francesco; Oliviero, Salvatore; Mauro, Alessandro; Geley, Stephan; Gatti, Maurizio; Di Cunto, Ferdinando
Rictor/mTORC2 deficiency enhances keratinocyte stress tolerance via mitohormesis. 2017 Beatrice, Tassone; Stefania, Saoncella; Francesco, Neri; Ugo, Ala; Davide, Brusa; Magnuson Mark, A; Paolo, Provero; Salvatore, Oliviero; Chiara, Riganti; Enzo, Calautti
MicroRNAs-143 and -145 induce epithelial to mesenchymal transition and modulate the expression of junction proteins 2017 Avalle, Lidia; Incarnato, Danny; Savino, Aurora; Gai, Marta; Marino, Francesca; Pensa, Sara; Barbieri, Isaia; Stadler, Michael B; Provero, Paolo; Oliviero, Salvatore; Poli, Valeria
In vivo probing of nascent RNA structures reveals principles of cotranscriptional folding 2017 Incarnato D.; Morandi E.; Anselmi F.; Simon L.M.; Basile G.; Oliviero S.
The IKK/NF-κB signaling pathway requires Morgana to drive breast cancer metastasis 2017 Fusella, Federica; Secli', Laura; Busso, Elena; Krepelova, Anna; Moiso, Enrico; Rocca, Stefania; Conti, Laura; Annaratone, Laura; Rubinetto, Cristina; MELLO GRAND, Maurizia; Singh, VIJAY KUMAR; Chiorino, Giovanna; Silengo, Lorenzo; Altruda, Fiorella; Turco, Emilia; Morotti, Alessandro; Oliviero, Salvatore; Castellano, Isabella; Cavallo, Federica; Provero, Paolo; Tarone, Guido; Brancaccio, Mara
Locked and Loaded: Inflammation Training Prepares Skin Epithelial Stem Cells for Trauma 2017 Proserpio, Valentina; Oliviero, Salvatore; Donati, Giacomo
Mutations in NOTCH1 PEST Domain Orchestrate CCL19-Driven Homing of Chronic Lymphocytic Leukemia (CLL) Cells By Modulating the Gene DUSP22 2016 Arruga, F; Gizdic, B; Bologna, C; Cignetto, S; Buonincontri, R; Serra, S; Vaisitti, T; Vitale, N; Garaffo, G; Mereu, E; Diop, F; Neri, F; Coscia, M; Allan, JN; Piva, R; Oliviero, S; Furman, RR; Rossi, D; Gaidano, G; Deaglio, S
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