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Titolo Data di pubblicazione Autore(i) File
Stardust: improving spatial transcriptomics data analysis through space-aware modularity optimization-based clustering 2022 Avesani, Simone; Viesi, Eva; Alessandrì, Luca; Motterle, Giovanni; Bonnici, Vincenzo; Beccuti, Marco; Calogero, Raffaele; Giugno, Rosalba
Extracellular Vesicles Derived From Plasma of Patients With Neurodegenerative Disease Have Common Transcriptomic Profiling 2022 Sproviero D.; Gagliardi S.; Zucca S.; Arigoni M.; Giannini M.; Garofalo M.; Fantini V.; Pansarasa O.; Avenali M.; Ramusino M.C.; Diamanti L.; Minafra B.; Perini G.; Zangaglia R.; Costa A.; Ceroni M.; Calogero R.A.; Cereda C.
Circulating Extracellular Vesicles Contain Liver-Derived RNA Species as Indicators of Severe Cholestasis-Induced Early Liver Fibrosis in Mice 2022 Fagoonee, Sharmila; Arigoni, Maddalena; Manco, Marta; Olivero, Martina; Bizzaro, Francesca; Magagnotti, Cinzia; Andolfo, Annapaola; Miniscalco, Barbara; Forni, Marco; Todeschi, Stefano; Tolosano, Emanuela; Bocchietto, Elena; Calogero, Raffaele; Altruda, Fiorella
Sparsely-connected autoencoder (SCA) for single cell RNAseq data mining 2021 Luca Alessandri, Francesca Cordero, Marco Beccuti, Nicola Licheri, Maddalena Arigoni, Martina Olivero, Maria Flavia Di Renzo, Anna Sapino, Raffaele Calogero
Laniakea@ReCaS: exploring the potential of customisable Galaxy on-demand instances as a cloud-based service 2021 Tangaro M.A.; Mandreoli P.; Chiara M.; Donvito G.; Antonacci M.; Parisi A.; Bianco A.; Romano A.; Bianchi D.M.; Cangelosi D.; Uva P.; Molineris I.; Nosi V.; Calogero R.A.; Alessandri L.; Pedrini E.; Mordenti M.; Bonetti E.; Sangiorgi L.; Pesole G.; Zambelli F.
Early stability and late random tumor progression of a HER2-positive primary breast cancer patient-derived xenograft 2021 Landuzzi L.; Palladini A.; Ceccarelli C.; Asioli S.; Nicoletti G.; Giusti V.; Ruzzi F.; Ianzano M.L.; Scalambra L.; Laranga R.; Balboni T.; Arigoni M.; Olivero M.; Calogero R.A.; De Giovanni C.; Dall'Ora M.; Di Oto E.; Santini D.; Foschini M.P.; Cucchi M.C.; Zanotti S.; Taffurelli M.; Nanni P.; Lollini P.-L.
Circulating miRNome of Trachemys scripta after elective gonadectomy under general anesthesia 2021 Bardi E.; Brizzola S.; Ravasio G.; Romussi S.; Dall'Ara P.; Zamarian V.; Arigoni M.; Calogero R.A.; Lecchi C.
Data discrepancies and substandard reporting of interim data of Sputnik V phase 3 trial 2021 Bucci E.M.; Berkhof J.; Gillibert A.; Gopalakrishna G.; Calogero R.A.; Bouter L.M.; Andreev K.; Naudet F.; Vlassov V.
Sparsely connected autoencoders: A multi‐purpose tool for single cell omics analysis 2021 Alessandri L.; Ratto M.L.; Contaldo S.G.; Beccuti M.; Cordero F.; Arigoni M.; Calogero R.A.
Evolution of HER2-positive mammary carcinoma: HER2 loss reveals claudin-low traits in cancer progression 2021 Giusti V.; Ruzzi F.; Landuzzi L.; Ianzano M.L.; Laranga R.; Nironi E.; Scalambra L.; Nicoletti G.; De Giovanni C.; Olivero M.; Arigoni M.; Calogero R.; Nanni P.; Palladini A.; Lollini P.-L.
Computational Analysis of circRNA Expression Data 2021 Ferrero G.; Licheri N.; De Bortoli M.; Calogero R.A.; Beccuti M.; Cordero F.
Met exon 14 skipping: A case study for the detection of genetic variants in cancer driver genes by deep learning 2021 Nosi V.; Luca A.; Milan M.; Arigoni M.; Benvenuti S.; Cacchiarelli D.; Cesana M.; Riccardo S.; Filippo L.D.; Cordero F.; Beccuti M.; Comoglio P.M.; Calogero R.A.
Frequent mutations of FBXO11 highlight BCL6 as a therapeutic target in Burkitt lymphoma 2021 Pighi C.; Cheong T.-C.; Compagno M.; Patrucco E.; Arigoni M.; Olivero M.; Wang Q.; Lopez C.; Bernhart S.H.; Grande B.M.; Poggio T.; Langellotto F.; Bonello L.; Dall'Olio R.; Martinez-Martin S.; Molinaro L.; di Celle P.F.; Whitfield J.R.; Soucek L.; Voena C.; Calogero R.A.; Morin R.D.; Staudt L.M.; Siebert R.; Zamo A.; Chiarle R.
Identification of Teneurin 4 as a novel cancer-stem cell associated antigen and potential biomarker. 2021 Peppino G., Barutello G., Ruiu R., Arigoni M., Riccardo F., Conti L., Calogero R.A., Quaglino E.
Identification of TENM4 as a novel cancer stem cell-associated molecule and potential target in triple negative breast cancer 2021 Ruiu R.; Barutello G.; Arigoni M.; Riccardo F.; Conti L.; Peppino G.; Annaratone L.; Marchio C.; Mengozzi G.; Calogero R.A.; Cavallo F.; Quaglino E.
Application of the Euro Clonality next-generation sequencing-based marker screening approach to detect immunoglobulin heavy chain rearrangements in mantle cell lymphoma patients: first data from the Fondazione Italiana Linfomi MCL0208 trial 2021 Genuardi, Elisa; Romano, Greta; Beccuti, Marco; Alessandria, Beatrice; Mannina, Donato; Califano, Catello; Rota Scalabrini, Delia; Cortelazzo, Sergio; Ladetto, Marco; Ferrero, Simone; Calogero, Raffaele A; Cordero, Francesca
Computational Analysis of Single-Cell RNA-Seq Data 2021 Alessandri L.; Cordero F.; Beccuti M.; Arigoni M.; Calogero R.A.
Different mirna profiles in plasma derived small and large extracellular vesicles from patients with neurodegenerative diseases 2021 Sproviero D.; Gagliardi S.; Zucca S.; Arigoni M.; Giannini M.; Garofalo M.; Olivero M.; Dell'orco M.; Pansarasa O.; Bernuzzi S.; Avenali M.; Ramusino M.C.; Diamanti L.; Minafra B.; Perini G.; Zangaglia R.; Costa A.; Ceroni M.; Perrone-bizzozero N.I.; Calogero R.A.; Cereda C.
Regenerative Reprogramming of the Intestinal Stem Cell State via Hippo Signaling Suppresses Metastatic Colorectal Cancer 2020 Cheung P.; Xiol J.; Dill M.T.; Yuan W.-C.; Panero R.; Roper J.; Osorio F.G.; Maglic D.; Li Q.; Gurung B.; Calogero R.A.; Yilmaz O.H.; Mao J.; Camargo F.D.
Identification of Altered miRNAs in Cerumen of Dogs Affected by Otitis Externa 2020 Lecchi C.; Zamarian V.; Borriello G.; Galiero G.; Grilli G.; Caniatti M.; D'Urso E.S.; Roccabianca P.; Perego R.; Minero M.; Legnani S.; Calogero R.; Arigoni M.; Ceciliani F.
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