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Realizability and strong normalization for a curry-howard interpretation of HA + EM1 2013 Aschieri, Federico; Berardi, Stefano; Birolo, Giovanni
QueryOR: A comprehensive web platform for genetic variant analysis and prioritization 2017 Bertoldi L.; Forcato C.; Vitulo N.; Birolo G.; De Pascale F.; Feltrin E.; Schiavon R.; Anglani F.; Negrisolo S.; Zanetti A.; D'Avanzo F.; Tomanin R.; Faulkner G.; Vezzi A.; Valle G.
SNP-discovery by RAD-sequencing in a germplasm collection of wild and cultivated grapevines (V. vinifera L.) 2017 Marrano A.; Birolo G.; Prazzoli M.L.; Lorenzi S.; Valle G.; Grando M.S.
microRNA profiles in urine by next-generation sequencing can stratify bladder cancer subtypes 2018 Pardini Barbara, Cordero Francesca, Naccarati Alessio, Viberti Clara, Birolo Giovanni, Oderda Marco, Di Gaetano Cornelia, Arigoni Maddalena, Martina Federica, Calogero Raffaele, Sacerdote Carlotta, Gontero Paolo, Vineis Paolo, Matullo Giuseppe
Population structure of modern-day Italians reveals patterns of ancient and archaic ancestries in Southern Europe 2019 Raveane A.; Aneli S.; Montinaro F.; Athanasiadis G.; Barlera S.; Birolo G.; Boncoraglio G.; Di Blasio A.M.; Di Gaetano C.; Pagani L.; Parolo S.; Paschou P.; Piazza A.; Stamatoyannopoulos G.; Angius A.; Brucato N.; Cucca F.; Hellenthal G.; Mulas A.; Peyret-Guzzon M.; Zoledziewska M.; Baali A.; Bycroft C.; Cherkaoui M.; Chiaroni J.; Di Cristofaro J.; Dina C.; Dugoujon J.M.; Galan P.; Giemza J.; Kivisild T.; Mazieres S.; Melhaoui M.; Metspalu M.; Myers S.; Pereira L.; Ricaut F.X.; Brisighelli F.; Cardinali I.; Grugni V.; Lancioni H.; Pascali V.L.; Torroni A.; Semino O.; Matullo G.; Achilli A.; Olivieri A.; Capelli C.
Noncoding rnas in extracellular fluids as cancer biomarkers: The new frontier of liquid biopsies 2019 Pardini B.; Sabo A.A.; Birolo G.; Calin G.A.
Small non-coding RNA profiling in plasma extracellular vesicles of bladder cancer patients by next-generation sequencing: Expression levels of miR-126-3p and piR-5936 increase with higher histologic grades 2020 Sabo A.A.; Birolo G.; Naccarati A.; Dragomir M.P.; Aneli S.; Allione A.; Oderda M.; Allasia M.; Gontero P.; Sacerdote C.; Vineis P.; Matullo G.; Pardini B.
Limitations and challenges in protein stability prediction upon genome variations: towards future applications in precision medicine 2020 Sanavia T.; Birolo G.; Montanucci L.; Turina P.; Capriotti E.; Fariselli P.
ACE2 gene variants may underlie interindividual variability and susceptibility to COVID-19 in the Italian population 2020 Benetti E.; Tita R.; Spiga O.; Ciolfi A.; Birolo G.; Bruselles A.; Doddato G.; Giliberti A.; Marconi C.; Musacchia F.; Pippucci T.; Torella A.; Trezza A.; Valentino F.; Baldassarri M.; Brusco A.; Asselta R.; Bruttini M.; Furini S.; Seri M.; Nigro V.; Matullo G.; Tartaglia M.; Mari F.; Elisa F.; Chiara F.; Sergio D.; Susanna C.; Sara A.; Francesca F.; Montagnani F.; Di Sarno L.; Tommasi A.; Palmieri M.; Emiliozzi A.; Fabbiani M.; Rossetti B.; Zanelli G.; Bergantini L.; D'Alessandro M.; Cameli P.; Bennet D.; Anedda F.; Marcantonio S.; Scolletta S.; Franchi F.; Mazzei M.A.; Conticini E.; Cantarini L.; Frediani B.; Tacconi D.; Feri M.; Scala R.; Spargi G.; Corridi M.; Nencioni C.; Caldarelli G.P.; Spagnesi M.; Piacentini P.; Bandini M.; Desanctis E.; Canaccini A.; Spertilli C.; Donati A.; Guidelli L.; Croci L.; Verzuri A.; Anemoli V.; Ognibene A.; Vaghi M.; D'Arminio Monforte A.; Merlini E.; Mondelli M.U.; Mantovani S.; Ludovisi S.; Girardis M.; Venturelli S.; Sita M.; Cossarizza A.; Antinori A.; Vergori A.; Rusconi S.; Siano M.; Gabrieli A.; Riva A.; Francisci D.; Schiaroli E.; Scotton P.G.; Andretta F.; Panese S.; Scaggiante R.; Parisi S.G.; Castelli F.; Quiros-Roldan M.E.; Magro P.; Minardi C.; Castelli D.; Polesini I.; Della Monica M.; Piscopo C.; Capasso M.; Russo R.; Andolfo I.; Iolascon A.; Carella M.; Castori M.; Merla G.; Aucella F.; Raggi P.; Marciano C.; Perna R.; Bassetti M.; Di Biagio A.; Sanguinetti M.; Masucci L.; Gabbi C.; Valente S.; Guerrini S.; Meloni I.; Mencarelli M.A.; Rizzo C.L.; Bargagli E.; Mandala M.; Giorli A.; Salerni L.; Fiorentino G.; Zucchi P.; Parravicini P.; Menatti E.; Baratti S.; Trotta T.; Giannattasio F.; Coiro G.; Lena F.; Coviello D.A.; Mussini C.; Renieri A.; Pinto A.M.
Functional and clinical implications of genetic structure in 1686 Italian exomes 2021 Birolo, Giovanni; Aneli, Serena; Di Gaetano, Cornelia; Cugliari, Giovanni; Russo, Alessia; Allione, Alessandra; Casalone, Elisabetta; Giorgio, Elisa; Paraboschi, Elvezia Maria; Ardissino, Diego; Duga, Stefano; Asselta, Rosanna; Matullo, Giuseppe
Identification of novel circulating microRNAs in advanced heart failure by next-generation sequencing 2021 Galluzzo A.; Gallo S.; Pardini B.; Birolo G.; Fariselli P.; Boretto P.; Vitacolonna A.; Peraldo-Neia C.; Spilinga M.; Volpe A.; Celentani D.; Pidello S.; Bonzano A.; Matullo G.; Giustetto C.; Bergerone S.; Crepaldi T.
A deep-learning sequence-based method to predict protein stability changes upon genetic variations 2021 Pancotti C.; Benevenuta S.; Repetto V.; Birolo G.; Capriotti E.; Sanavia T.; Fariselli P.
Dadaist2: A toolkit to automate and simplify statistical analysis and plotting of metabarcoding experiments 2021 Ansorge R.; Birolo G.; James S.A.; Telatin A.
Employing a systematic approach to biobanking and analyzing clinical and genetic data for advancing COVID-19 research 2021 Daga S.; Fallerini C.; Baldassarri M.; Fava F.; Valentino F.; Doddato G.; Benetti E.; Furini S.; Giliberti A.; Tita R.; Amitrano S.; Bruttini M.; Meloni I.; Pinto A.M.; Raimondi F.; Stella A.; Biscarini F.; Picchiotti N.; Gori M.; Pinoli P.; Ceri S.; Sanarico M.; Crawley F.P.; Birolo G.; Montagnani F.; Di Sarno L.; Tommasi A.; Palmieri M.; Croci S.; Emiliozzi A.; Fabbiani M.; Rossetti B.; Zanelli G.; Bergantini L.; D'Alessandro M.; Cameli P.; Bennet D.; Anedda F.; Marcantonio S.; Scolletta S.; Franchi F.; Mazzei M.A.; Guerrini S.; Conticini E.; Cantarini L.; Frediani B.; Tacconi D.; Spertilli C.; Feri M.; Donati A.; Scala R.; Guidelli L.; Spargi G.; Corridi M.; Nencioni C.; Croci L.; Caldarelli G.P.; Spagnesi M.; Piacentini P.; Bandini M.; Desanctis E.; Cappelli S.; Canaccini A.; Verzuri A.; Anemoli V.; Ognibene A.; Vaghi M.; D'Arminio Monforte A.; Merlini E.; Mondelli M.U.; Mantovani S.; Ludovisi S.; Girardis M.; Venturelli S.; Sita M.; Cossarizza A.; Antinori A.; Vergori A.; Rusconi S.; Siano M.; Gabrieli A.; Riva A.; Francisci D.; Schiaroli E.; Scotton P.G.; Andretta F.; Panese S.; Scaggiante R.; Gatti F.; Parisi S.G.; Castelli F.; Quiros-Roldan M.E.; Magro P.; Zanella I.; Della Monica M.; Piscopo C.; Capasso M.; Russo R.; Andolfo I.; Iolascon A.; Fiorentino G.; Carella M.; Castori M.; Merla G.; Aucella F.; Raggi P.; Marciano C.; Perna R.; Bassetti M.; Di Biagio A.; Sanguinetti M.; Masucci L.; Gabbi C.; Valente S.; Meloni I.; Mencarelli M.A.; Rizzo C.L.; Bargagli E.; Mandala M.; Giorli A.; Salerni L.; Zucchi P.; Parravicini P.; Menatti E.; Baratti S.; Trotta T.; Giannattasio F.; Coiro G.; Lena F.; Coviello D.A.; Mussini C.; Bosio G.; Mancarella S.; Tavecchia L.; Renieri A.; Mari F.; Frullanti E.
Usefulness of a Hepatitis B Surface Antigen-Based Model for the Prediction of Functional Cure in Patients with Chronic Hepatitis B Virus Infection Treated with Nucleos(t)ide Analogues: A Real-World Study 2021 Caviglia, Gian Paolo; Troshina, Yulia; Garro, Enrico; Gesualdo, Marcantonio; Aneli, Serena; Birolo, Giovanni; Pittaluga, Fabrizia; Cavallo, Rossana; Saracco, Giorgio Maria; Ciancio, Alessia
An antisymmetric neural network to predict free energy changes in protein variants 2021 Benevenuta S.; Pancotti C.; Fariselli P.; Birolo G.; Sanavia T.
Seqfu: A suite of utilities for the robust and reproducible manipulation of sequence files 2021 Telatin A.; Fariselli P.; Birolo G.
Analysis of italian BRCA1/2 pathogenic variants identifies a private spectrum in the population from the Bergamo Province in northern Italy 2021 Figlioli G.; De Nicolo A.; Catucci I.; Manoukian S.; Peissel B.; Azzollini J.; Beltrami B.; Bonanni B.; Calvello M.; Bondavalli D.; Pasini B.; Lutati F.V.; Ogliara P.; Zuradelli M.; Pensotti V.; De Vecchi G.; Volorio S.; Verderio P.; Pizzamiglio S.; Matullo G.; Aneli S.; Birolo G.; Zanardi F.; Tondini C.; Zambelli A.; Livraghi L.; Franchi M.; Radice P.; Peterlongo P.
Genetic and epigenetic characterization of a discordant kmt2a/aff1-rearranged infant monozygotic twin pair 2021 Russo A.; Viberti C.; Mareschi K.; Casalone E.; Guarrera S.; Birolo G.; Cazzaniga G.; Corral L.; Trentin L.; Basso G.; Fagioli F.; Matullo G.
ACDC-NN: a deep learning predictor of protein stability change upon mutation. 2021 Benevenuta S, Pancotti C, Fariselli P, Birolo G, SANAVIA T
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