LICHERI, Nicola

LICHERI, Nicola  

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A fecal microRNA signature by small RNA sequencing accurately distinguishes colorectal cancers: results from a multicentric study 2023 Pardini, Barbara; Ferrero, Giulio; Tarallo, Sonia; Gallo, Gaetano; Francavilla, Antonio; Licheri, Nicola; Trompetto, Mario; Clerico, Giuseppe; Senore, Carlo; Peyre, Sergio; Vymetalkova, Veronika; Vodickova, Ludmila; Liska, Vaclav; Vycital, Ondrej; Levy, Miroslav; Macinga, Peter; Hucl, Tomas; Budinska, Eva; Vodicka, Pavel; Cordero, Francesca; Naccarati, Alessio
A novel machine-learning framework based on early embryo morphokinetics identifies a feature signature associated with blastocyst development 2024 Canosa, S.; Licheri, N.; Bergandi, L.; Gennarelli, G.; Paschero, C.; Beccuti, M.; Cimadomo, D.; Coticchio, G.; Rienzi, L.; Benedetto, C.; Cordero, F.; Revelli, A.
An entropy heuristic to optimize decision diagrams for index-driven search in biological graph databases 2021 Licheri N.; Amparore E.; Bonnici V.; Giugno R.; Beccuti M.
Artificial intelligence methods for biomedical imaging and omics data 2023 Barbano C.A.; Beccuti M.; Cordero F.; Ivanov D.N.; Licheri N.; Pernice S.; Presta A.; Renzulli R.; Grangetto M.
Computational Analysis of circRNA Expression Data 2021 Ferrero G.; Licheri N.; De Bortoli M.; Calogero R.A.; Beccuti M.; Cordero F.
Docker4Circ: A Framework for the Reproducible Characterization of circRNAs from RNA-Seq Data 2020 Ferrero, Giulio; Licheri, Nicola; Coscujuela Tarrero, Lucia; De Intinis, Carlo; Miano, Valentina; Calogero, Raffaele Adolfo; Cordero, Francesca; De Bortoli, Michele; Beccuti, Marco
Embracing Complexity for Integrative Multi-Omics Approaches in Life Sciences 2024 -
GRAPES-DD: exploiting decision diagrams for index-driven search in biological graph databases 2021 Nicola Licheri, Vincenzo Bonnici, Marco Beccuti, Rosalba Giugno
Integrative circRNA profiling from RNA-sequencing of colorectal cancer and adenoma tissues shows a downregulation in early stages of the disease 2024 Alessandro Camandona, Amedeo Gagliardi, Nicola Licheri, Denise Festa, Sonia Tarallo, Santina Cutrupi, Michele De Bortoli, Barbara Pardini, Alessio Naccarati, Giulio Ferrero
MethylFASTQ: A Tool Simulating Bisulfite Sequencing Data 2019 Piaggeschi, Giulia; Licheri, Nicola; Romano, Greta; Pernice, Simone; Follia, Laura; Ferrero, Giulio
Multiple regulatory events contribute to a widespread circular RNA downregulation in precancer and early stage of colorectal cancer development 2025 Camandona, Alessandro; Gagliardi, Amedeo; Licheri, Nicola; Tarallo, Sonia; Francescato, Giulia; Budinska, Eva; Carnogurska, Martina; Zwinsová, Barbora; Martinoglio, Barbara; Franchitti, Lorenzo; Gallo, Gaetano; Cutrupi, Santina; De Bortoli, Michele; Pardini, Barbara; Naccarati, Alessio; Ferrero, Giulio
rCASC: reproducible classification analysis of single-cell sequencing data 2019 Alessandrì, Luca; Cordero, Francesca; Beccuti, Marco; Arigoni, Maddalena; Olivero, Martina; Romano, Greta; Rabellino, Sergio; Licheri, Nicola; De Libero, Gennaro; Pace, Luigia; Calogero, Raffaele A
Sparsely-connected autoencoder (SCA) for single cell RNAseq data mining 2021 Luca Alessandri, Francesca Cordero, Marco Beccuti, Nicola Licheri, Maddalena Arigoni, Martina Olivero, Maria Flavia Di Renzo, Anna Sapino, Raffaele Calogero
Synergy Between Mechanistic Modelling and Ensemble Feature Selection Approaches to Explore Multiscale Biological Heterogeneity 2025 Aucello, Riccardo; Licheri, Nicola; Rosso, Elena; Ferrero, Giulio; Gepiro Contaldo, Sandro; Pernice, Simone; Lió, Pietro; Cordero, Francesca; Beccuti, Marco