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Computational Analysis of Single-Cell RNA-Seq Data 2021 Alessandri L.; Cordero F.; Beccuti M.; Arigoni M.; Calogero R.A.
MET Exon 14 Skipping: A Case Study for the Detection of Genetic Variants in Cancer Driver Genes by Deep Learning 2021 Nosi, Vladimir; Luca, Alessandrì; Milan, Melissa; Arigoni, Maddalena; Benvenuti, Silvia; Cacchiarelli, Davide; Cesana, Marcella; Riccardo, Sara; Di Filippo, Lucio; Cordero, Francesca; Beccuti, Marco; Comoglio, Paolo M.; Calogero, Raffaele A.
Computational Analysis of circRNA Expression Data 2021 Ferrero G.; Licheri N.; De Bortoli M.; Calogero R.A.; Beccuti M.; Cordero F.
Laniakea@ReCaS: exploring the potential of customisable Galaxy on-demand instances as a cloud-based service 2021 Tangaro M.A.; Mandreoli P.; Chiara M.; Donvito G.; Antonacci M.; Parisi A.; Bianco A.; Romano A.; Bianchi D.M.; Cangelosi D.; Uva P.; Molineris I.; Nosi V.; Calogero R.A.; Alessandri L.; Pedrini E.; Mordenti M.; Bonetti E.; Sangiorgi L.; Pesole G.; Zambelli F.
Data discrepancies and substandard reporting of interim data of Sputnik V phase 3 trial 2021 Bucci E.M.; Berkhof J.; Gillibert A.; Gopalakrishna G.; Calogero R.A.; Bouter L.M.; Andreev K.; Naudet F.; Vlassov V.
Frequent mutations of FBXO11 highlight BCL6 as a therapeutic target in Burkitt lymphoma 2021 Pighi C.; Cheong T.-C.; Compagno M.; Patrucco E.; Arigoni M.; Olivero M.; Wang Q.; Lopez C.; Bernhart S.H.; Grande B.M.; Poggio T.; Langellotto F.; Bonello L.; Dall'Olio R.; Martinez-Martin S.; Molinaro L.; di Celle P.F.; Whitfield J.R.; Soucek L.; Voena C.; Calogero R.A.; Morin R.D.; Staudt L.M.; Siebert R.; Zamo A.; Chiarle R.
Circulating miRNome of Trachemys scripta after elective gonadectomy under general anesthesia 2021 Bardi E.; Brizzola S.; Ravasio G.; Romussi S.; Dall'Ara P.; Zamarian V.; Arigoni M.; Calogero R.A.; Lecchi C.
Evolution of HER2-positive mammary carcinoma: HER2 loss reveals claudin-low traits in cancer progression 2021 Giusti V.; Ruzzi F.; Landuzzi L.; Ianzano M.L.; Laranga R.; Nironi E.; Scalambra L.; Nicoletti G.; De Giovanni C.; Olivero M.; Arigoni M.; Calogero R.; Nanni P.; Palladini A.; Lollini P.-L.
Different mirna profiles in plasma derived small and large extracellular vesicles from patients with neurodegenerative diseases 2021 Sproviero D.; Gagliardi S.; Zucca S.; Arigoni M.; Giannini M.; Garofalo M.; Olivero M.; Dell'orco M.; Pansarasa O.; Bernuzzi S.; Avenali M.; Ramusino M.C.; Diamanti L.; Minafra B.; Perini G.; Zangaglia R.; Costa A.; Ceroni M.; Perrone-bizzozero N.I.; Calogero R.A.; Cereda C.
Early stability and late random tumor progression of a HER2-positive primary breast cancer patient-derived xenograft 2021 Landuzzi L.; Palladini A.; Ceccarelli C.; Asioli S.; Nicoletti G.; Giusti V.; Ruzzi F.; Ianzano M.L.; Scalambra L.; Laranga R.; Balboni T.; Arigoni M.; Olivero M.; Calogero R.A.; De Giovanni C.; Dall'Ora M.; Di Oto E.; Santini D.; Foschini M.P.; Cucchi M.C.; Zanotti S.; Taffurelli M.; Nanni P.; Lollini P.-L.
Sparsely-connected autoencoder (SCA) for single cell RNAseq data mining 2021 Luca Alessandri, Francesca Cordero, Marco Beccuti, Nicola Licheri, Maddalena Arigoni, Martina Olivero, Maria Flavia Di Renzo, Anna Sapino, Raffaele Calogero
Sparsely connected autoencoders: A multi‐purpose tool for single cell omics analysis 2021 Alessandri L.; Ratto M.L.; Contaldo S.G.; Beccuti M.; Cordero F.; Arigoni M.; Calogero R.A.
Identification of TENM4 as a novel cancer stem cell-associated molecule and potential target in triple negative breast cancer 2021 Ruiu R.; Barutello G.; Arigoni M.; Riccardo F.; Conti L.; Peppino G.; Annaratone L.; Marchio C.; Mengozzi G.; Calogero R.A.; Cavallo F.; Quaglino E.
Application of the Euro Clonality next-generation sequencing-based marker screening approach to detect immunoglobulin heavy chain rearrangements in mantle cell lymphoma patients: first data from the Fondazione Italiana Linfomi MCL0208 trial 2021 Genuardi, Elisa; Romano, Greta; Beccuti, Marco; Alessandria, Beatrice; Mannina, Donato; Califano, Catello; Rota Scalabrini, Delia; Cortelazzo, Sergio; Ladetto, Marco; Ferrero, Simone; Calogero, Raffaele A; Cordero, Francesca
Live-animal imaging of native haematopoietic stem and progenitor cells 2020 Christodoulou C.; Spencer J.A.; Yeh S.-C.A.; Turcotte R.; Kokkaliaris K.D.; Panero R.; Ramos A.; Guo G.; Seyedhassantehrani N.; Esipova T.V.; Vinogradov S.A.; Rudzinskas S.; Zhang Y.; Perkins A.S.; Orkin S.H.; Calogero R.A.; Schroeder T.; Lin C.P.; Camargo F.D.
Molecular and functional characterization of urine-derived podocytes from patients with Alport syndrome 2020 Iampietro C.; Bellucci L.; Arcolino F.O.; Arigoni M.; Alessandrì L.; Gomez Y.; Papadimitriou E.; Calogero R.A.; Cocchi E.; Van Den Heuvel L.; Levtchenko E.; Bussolati B.
Safety and efficacy of the Russian COVID-19 vaccine: more information needed 2020 Bucci E.; Andreev K.; Bjorkman A.; Calogero R.A.; Carafoli E.; Carninci P.; Castagnoli P.; Cossarizza A.; Mussini C.; Guerin P.; Lipworth B.; Sbardella G.; Stocki T.; Tuosto L.; van Tulleken C.; Viola A.
miRNA profiles of canine cutaneous mast cell tumours with early nodal metastasis and evaluation as potential biomarkers 2020 Zamarian V.; Ferrari R.; Stefanello D.; Ceciliani F.; Grieco V.; Minozzi G.; Chiti L.E.; Arigoni M.; Calogero R.; Lecchi C.
A regulatory microRNA network controls endothelial cell phenotypic switch during sprouting angiogenesis 2020 Rosano S.; Cora D.; Parab S.; Zaffuto S.; Isella C.; Porporato R.; Hoza R.M.; Calogero R.A.; Riganti C.; Bussolino F.; Noghero A.
Multiple sclerosis disease: A computational approach for investigating its drug interactions 2020 Pernice S.; Beccuti M.; Romano G.; Pennisi M.; Maglione A.; Cutrupi S.; Pappalardo F.; Capra L.; Franceschinis G.; De Pierro M.; Balbo G.; Cordero F.; Calogero R.
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