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Extracellular Vesicles Derived From Plasma of Patients With Neurodegenerative Disease Have Common Transcriptomic Profiling
2022-01-01 Sproviero D.; Gagliardi S.; Zucca S.; Arigoni M.; Giannini M.; Garofalo M.; Fantini V.; Pansarasa O.; Avenali M.; Ramusino M.C.; Diamanti L.; Minafra B.; Perini G.; Zangaglia R.; Costa A.; Ceroni M.; Calogero R.A.; Cereda C.
Circulating Extracellular Vesicles Contain Liver-Derived RNA Species as Indicators of Severe Cholestasis-Induced Early Liver Fibrosis in Mice
2022-01-01 Fagoonee, Sharmila; Arigoni, Maddalena; Manco, Marta; Olivero, Martina; Bizzaro, Francesca; Magagnotti, Cinzia; Andolfo, Annapaola; Miniscalco, Barbara; Forni, Marco; Todeschi, Stefano; Tolosano, Emanuela; Bocchietto, Elena; Calogero, Raffaele; Altruda, Fiorella
Computational Analysis of circRNA Expression Data
2021-01-01 Ferrero G.; Licheri N.; De Bortoli M.; Calogero R.A.; Beccuti M.; Cordero F.
Identification of Teneurin 4 as a novel cancer-stem cell associated antigen and potential biomarker.
2021-01-01 Peppino G., Barutello G., Ruiu R., Arigoni M., Riccardo F., Conti L., Calogero R.A., Quaglino E.
Identification of TENM4 as a novel cancer stem cell-associated molecule and potential target in triple negative breast cancer
2021-01-01 Ruiu R.; Barutello G.; Arigoni M.; Riccardo F.; Conti L.; Peppino G.; Annaratone L.; Marchio C.; Mengozzi G.; Calogero R.A.; Cavallo F.; Quaglino E.
Sparsely connected autoencoders: A multi‐purpose tool for single cell omics analysis
2021-01-01 Alessandri L.; Ratto M.L.; Contaldo S.G.; Beccuti M.; Cordero F.; Arigoni M.; Calogero R.A.
MET Exon 14 Skipping: A Case Study for the Detection of Genetic Variants in Cancer Driver Genes by Deep Learning
2021-01-01 Nosi, Vladimir; Luca, Alessandrì; Milan, Melissa; Arigoni, Maddalena; Benvenuti, Silvia; Cacchiarelli, Davide; Cesana, Marcella; Riccardo, Sara; Di Filippo, Lucio; Cordero, Francesca; Beccuti, Marco; Comoglio, Paolo M.; Calogero, Raffaele A.
Application of the Euro Clonality next-generation sequencing-based marker screening approach to detect immunoglobulin heavy chain rearrangements in mantle cell lymphoma patients: first data from the Fondazione Italiana Linfomi MCL0208 trial
2021-01-01 Genuardi, Elisa; Romano, Greta; Beccuti, Marco; Alessandria, Beatrice; Mannina, Donato; Califano, Catello; Rota Scalabrini, Delia; Cortelazzo, Sergio; Ladetto, Marco; Ferrero, Simone; Calogero, Raffaele A; Cordero, Francesca
Laniakea@ReCaS: exploring the potential of customisable Galaxy on-demand instances as a cloud-based service
2021-01-01 Tangaro M.A.; Mandreoli P.; Chiara M.; Donvito G.; Antonacci M.; Parisi A.; Bianco A.; Romano A.; Bianchi D.M.; Cangelosi D.; Uva P.; Molineris I.; Nosi V.; Calogero R.A.; Alessandri L.; Pedrini E.; Mordenti M.; Bonetti E.; Sangiorgi L.; Pesole G.; Zambelli F.
Data discrepancies and substandard reporting of interim data of Sputnik V phase 3 trial
2021-01-01 Bucci E.M.; Berkhof J.; Gillibert A.; Gopalakrishna G.; Calogero R.A.; Bouter L.M.; Andreev K.; Naudet F.; Vlassov V.
Frequent mutations of FBXO11 highlight BCL6 as a therapeutic target in Burkitt lymphoma
2021-01-01 Pighi C.; Cheong T.-C.; Compagno M.; Patrucco E.; Arigoni M.; Olivero M.; Wang Q.; Lopez C.; Bernhart S.H.; Grande B.M.; Poggio T.; Langellotto F.; Bonello L.; Dall'Olio R.; Martinez-Martin S.; Molinaro L.; di Celle P.F.; Whitfield J.R.; Soucek L.; Voena C.; Calogero R.A.; Morin R.D.; Staudt L.M.; Siebert R.; Zamo A.; Chiarle R.
Evolution of HER2-positive mammary carcinoma: HER2 loss reveals claudin-low traits in cancer progression
2021-01-01 Giusti V.; Ruzzi F.; Landuzzi L.; Ianzano M.L.; Laranga R.; Nironi E.; Scalambra L.; Nicoletti G.; De Giovanni C.; Olivero M.; Arigoni M.; Calogero R.; Nanni P.; Palladini A.; Lollini P.-L.
Circulating miRNome of Trachemys scripta after elective gonadectomy under general anesthesia
2021-01-01 Bardi E.; Brizzola S.; Ravasio G.; Romussi S.; Dall'Ara P.; Zamarian V.; Arigoni M.; Calogero R.A.; Lecchi C.
Early stability and late random tumor progression of a HER2-positive primary breast cancer patient-derived xenograft
2021-01-01 Landuzzi L.; Palladini A.; Ceccarelli C.; Asioli S.; Nicoletti G.; Giusti V.; Ruzzi F.; Ianzano M.L.; Scalambra L.; Laranga R.; Balboni T.; Arigoni M.; Olivero M.; Calogero R.A.; De Giovanni C.; Dall'Ora M.; Di Oto E.; Santini D.; Foschini M.P.; Cucchi M.C.; Zanotti S.; Taffurelli M.; Nanni P.; Lollini P.-L.
Computational Analysis of Single-Cell RNA-Seq Data
2021-01-01 Alessandri L.; Cordero F.; Beccuti M.; Arigoni M.; Calogero R.A.
Different mirna profiles in plasma derived small and large extracellular vesicles from patients with neurodegenerative diseases
2021-01-01 Sproviero D.; Gagliardi S.; Zucca S.; Arigoni M.; Giannini M.; Garofalo M.; Olivero M.; Dell'orco M.; Pansarasa O.; Bernuzzi S.; Avenali M.; Ramusino M.C.; Diamanti L.; Minafra B.; Perini G.; Zangaglia R.; Costa A.; Ceroni M.; Perrone-bizzozero N.I.; Calogero R.A.; Cereda C.
Sparsely-connected autoencoder (SCA) for single cell RNAseq data mining
2021-01-01 Luca Alessandri, Francesca Cordero, Marco Beccuti, Nicola Licheri, Maddalena Arigoni, Martina Olivero, Maria Flavia Di Renzo, Anna Sapino, Raffaele Calogero
Safety and efficacy of the Russian COVID-19 vaccine: more information needed
2020-01-01 Bucci E.; Andreev K.; Bjorkman A.; Calogero R.A.; Carafoli E.; Carninci P.; Castagnoli P.; Cossarizza A.; Mussini C.; Guerin P.; Lipworth B.; Sbardella G.; Stocki T.; Tuosto L.; van Tulleken C.; Viola A.
miRNA profiles of canine cutaneous mast cell tumours with early nodal metastasis and evaluation as potential biomarkers
2020-01-01 Zamarian V.; Ferrari R.; Stefanello D.; Ceciliani F.; Grieco V.; Minozzi G.; Chiti L.E.; Arigoni M.; Calogero R.; Lecchi C.
Docker4Circ: A Framework for the Reproducible Characterization of circRNAs from RNA-Seq Data
2020-01-01 Ferrero, Giulio; Licheri, Nicola; Coscujuela Tarrero, Lucia; De Intinis, Carlo; Miano, Valentina; Calogero, Raffaele Adolfo; Cordero, Francesca; De Bortoli, Michele; Beccuti, Marco
| Titolo | Data di pubblicazione | Autore(i) | File |
|---|---|---|---|
| Extracellular Vesicles Derived From Plasma of Patients With Neurodegenerative Disease Have Common Transcriptomic Profiling | 2022 | Sproviero D.; Gagliardi S.; Zucca S.; Arigoni M.; Giannini M.; Garofalo M.; Fantini V.; Pansarasa O.; Avenali M.; Ramusino M.C.; Diamanti L.; Minafra B.; Perini G.; Zangaglia R.; Costa A.; Ceroni M.; Calogero R.A.; Cereda C. | |
| Circulating Extracellular Vesicles Contain Liver-Derived RNA Species as Indicators of Severe Cholestasis-Induced Early Liver Fibrosis in Mice | 2022 | Fagoonee, Sharmila; Arigoni, Maddalena; Manco, Marta; Olivero, Martina; Bizzaro, Francesca; Magagnotti, Cinzia; Andolfo, Annapaola; Miniscalco, Barbara; Forni, Marco; Todeschi, Stefano; Tolosano, Emanuela; Bocchietto, Elena; Calogero, Raffaele; Altruda, Fiorella | |
| Computational Analysis of circRNA Expression Data | 2021 | Ferrero G.; Licheri N.; De Bortoli M.; Calogero R.A.; Beccuti M.; Cordero F. | |
| Identification of Teneurin 4 as a novel cancer-stem cell associated antigen and potential biomarker. | 2021 | Peppino G., Barutello G., Ruiu R., Arigoni M., Riccardo F., Conti L., Calogero R.A., Quaglino E. | |
| Identification of TENM4 as a novel cancer stem cell-associated molecule and potential target in triple negative breast cancer | 2021 | Ruiu R.; Barutello G.; Arigoni M.; Riccardo F.; Conti L.; Peppino G.; Annaratone L.; Marchio C.; Mengozzi G.; Calogero R.A.; Cavallo F.; Quaglino E. | |
| Sparsely connected autoencoders: A multi‐purpose tool for single cell omics analysis | 2021 | Alessandri L.; Ratto M.L.; Contaldo S.G.; Beccuti M.; Cordero F.; Arigoni M.; Calogero R.A. | |
| MET Exon 14 Skipping: A Case Study for the Detection of Genetic Variants in Cancer Driver Genes by Deep Learning | 2021 | Nosi, Vladimir; Luca, Alessandrì; Milan, Melissa; Arigoni, Maddalena; Benvenuti, Silvia; Cacchiarelli, Davide; Cesana, Marcella; Riccardo, Sara; Di Filippo, Lucio; Cordero, Francesca; Beccuti, Marco; Comoglio, Paolo M.; Calogero, Raffaele A. | |
| Application of the Euro Clonality next-generation sequencing-based marker screening approach to detect immunoglobulin heavy chain rearrangements in mantle cell lymphoma patients: first data from the Fondazione Italiana Linfomi MCL0208 trial | 2021 | Genuardi, Elisa; Romano, Greta; Beccuti, Marco; Alessandria, Beatrice; Mannina, Donato; Califano, Catello; Rota Scalabrini, Delia; Cortelazzo, Sergio; Ladetto, Marco; Ferrero, Simone; Calogero, Raffaele A; Cordero, Francesca | |
| Laniakea@ReCaS: exploring the potential of customisable Galaxy on-demand instances as a cloud-based service | 2021 | Tangaro M.A.; Mandreoli P.; Chiara M.; Donvito G.; Antonacci M.; Parisi A.; Bianco A.; Romano A.; Bianchi D.M.; Cangelosi D.; Uva P.; Molineris I.; Nosi V.; Calogero R.A.; Alessandri L.; Pedrini E.; Mordenti M.; Bonetti E.; Sangiorgi L.; Pesole G.; Zambelli F. | |
| Data discrepancies and substandard reporting of interim data of Sputnik V phase 3 trial | 2021 | Bucci E.M.; Berkhof J.; Gillibert A.; Gopalakrishna G.; Calogero R.A.; Bouter L.M.; Andreev K.; Naudet F.; Vlassov V. | |
| Frequent mutations of FBXO11 highlight BCL6 as a therapeutic target in Burkitt lymphoma | 2021 | Pighi C.; Cheong T.-C.; Compagno M.; Patrucco E.; Arigoni M.; Olivero M.; Wang Q.; Lopez C.; Bernhart S.H.; Grande B.M.; Poggio T.; Langellotto F.; Bonello L.; Dall'Olio R.; Martinez-Martin S.; Molinaro L.; di Celle P.F.; Whitfield J.R.; Soucek L.; Voena C.; Calogero R.A.; Morin R.D.; Staudt L.M.; Siebert R.; Zamo A.; Chiarle R. | |
| Evolution of HER2-positive mammary carcinoma: HER2 loss reveals claudin-low traits in cancer progression | 2021 | Giusti V.; Ruzzi F.; Landuzzi L.; Ianzano M.L.; Laranga R.; Nironi E.; Scalambra L.; Nicoletti G.; De Giovanni C.; Olivero M.; Arigoni M.; Calogero R.; Nanni P.; Palladini A.; Lollini P.-L. | |
| Circulating miRNome of Trachemys scripta after elective gonadectomy under general anesthesia | 2021 | Bardi E.; Brizzola S.; Ravasio G.; Romussi S.; Dall'Ara P.; Zamarian V.; Arigoni M.; Calogero R.A.; Lecchi C. | |
| Early stability and late random tumor progression of a HER2-positive primary breast cancer patient-derived xenograft | 2021 | Landuzzi L.; Palladini A.; Ceccarelli C.; Asioli S.; Nicoletti G.; Giusti V.; Ruzzi F.; Ianzano M.L.; Scalambra L.; Laranga R.; Balboni T.; Arigoni M.; Olivero M.; Calogero R.A.; De Giovanni C.; Dall'Ora M.; Di Oto E.; Santini D.; Foschini M.P.; Cucchi M.C.; Zanotti S.; Taffurelli M.; Nanni P.; Lollini P.-L. | |
| Computational Analysis of Single-Cell RNA-Seq Data | 2021 | Alessandri L.; Cordero F.; Beccuti M.; Arigoni M.; Calogero R.A. | |
| Different mirna profiles in plasma derived small and large extracellular vesicles from patients with neurodegenerative diseases | 2021 | Sproviero D.; Gagliardi S.; Zucca S.; Arigoni M.; Giannini M.; Garofalo M.; Olivero M.; Dell'orco M.; Pansarasa O.; Bernuzzi S.; Avenali M.; Ramusino M.C.; Diamanti L.; Minafra B.; Perini G.; Zangaglia R.; Costa A.; Ceroni M.; Perrone-bizzozero N.I.; Calogero R.A.; Cereda C. | |
| Sparsely-connected autoencoder (SCA) for single cell RNAseq data mining | 2021 | Luca Alessandri, Francesca Cordero, Marco Beccuti, Nicola Licheri, Maddalena Arigoni, Martina Olivero, Maria Flavia Di Renzo, Anna Sapino, Raffaele Calogero | |
| Safety and efficacy of the Russian COVID-19 vaccine: more information needed | 2020 | Bucci E.; Andreev K.; Bjorkman A.; Calogero R.A.; Carafoli E.; Carninci P.; Castagnoli P.; Cossarizza A.; Mussini C.; Guerin P.; Lipworth B.; Sbardella G.; Stocki T.; Tuosto L.; van Tulleken C.; Viola A. | |
| miRNA profiles of canine cutaneous mast cell tumours with early nodal metastasis and evaluation as potential biomarkers | 2020 | Zamarian V.; Ferrari R.; Stefanello D.; Ceciliani F.; Grieco V.; Minozzi G.; Chiti L.E.; Arigoni M.; Calogero R.; Lecchi C. | |
| Docker4Circ: A Framework for the Reproducible Characterization of circRNAs from RNA-Seq Data | 2020 | Ferrero, Giulio; Licheri, Nicola; Coscujuela Tarrero, Lucia; De Intinis, Carlo; Miano, Valentina; Calogero, Raffaele Adolfo; Cordero, Francesca; De Bortoli, Michele; Beccuti, Marco |
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