BIROLO, Giovanni

BIROLO, Giovanni  

SCIENZE MEDICHE  

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Titolo Data di pubblicazione Autore(i) File
A deep-learning sequence-based method to predict protein stability changes upon genetic variations 2021 Pancotti C.; Benevenuta S.; Repetto V.; Birolo G.; Capriotti E.; Sanavia T.; Fariselli P.
ACDC-NN: a deep learning predictor of protein stability change upon mutation. 2021 Benevenuta S, Pancotti C, Fariselli P, Birolo G, SANAVIA T
ACE2 gene variants may underlie interindividual variability and susceptibility to COVID-19 in the Italian population 2020 Benetti E.; Tita R.; Spiga O.; Ciolfi A.; Birolo G.; Bruselles A.; Doddato G.; Giliberti A.; Marconi C.; Musacchia F.; Pippucci T.; Torella A.; Trezza A.; Valentino F.; Baldassarri M.; Brusco A.; Asselta R.; Bruttini M.; Furini S.; Seri M.; Nigro V.; Matullo G.; Tartaglia M.; Mari F.; Elisa F.; Chiara F.; Sergio D.; Susanna C.; Sara A.; Francesca F.; Montagnani F.; Di Sarno L.; Tommasi A.; Palmieri M.; Emiliozzi A.; Fabbiani M.; Rossetti B.; Zanelli G.; Bergantini L.; D'Alessandro M.; Cameli P.; Bennet D.; Anedda F.; Marcantonio S.; Scolletta S.; Franchi F.; Mazzei M.A.; Conticini E.; Cantarini L.; Frediani B.; Tacconi D.; Feri M.; Scala R.; Spargi G.; Corridi M.; Nencioni C.; Caldarelli G.P.; Spagnesi M.; Piacentini P.; Bandini M.; Desanctis E.; Canaccini A.; Spertilli C.; Donati A.; Guidelli L.; Croci L.; Verzuri A.; Anemoli V.; Ognibene A.; Vaghi M.; D'Arminio Monforte A.; Merlini E.; Mondelli M.U.; Mantovani S.; Ludovisi S.; Girardis M.; Venturelli S.; Sita M.; Cossarizza A.; Antinori A.; Vergori A.; Rusconi S.; Siano M.; Gabrieli A.; Riva A.; Francisci D.; Schiaroli E.; Scotton P.G.; Andretta F.; Panese S.; Scaggiante R.; Parisi S.G.; Castelli F.; Quiros-Roldan M.E.; Magro P.; Minardi C.; Castelli D.; Polesini I.; Della Monica M.; Piscopo C.; Capasso M.; Russo R.; Andolfo I.; Iolascon A.; Carella M.; Castori M.; Merla G.; Aucella F.; Raggi P.; Marciano C.; Perna R.; Bassetti M.; Di Biagio A.; Sanguinetti M.; Masucci L.; Gabbi C.; Valente S.; Guerrini S.; Meloni I.; Mencarelli M.A.; Rizzo C.L.; Bargagli E.; Mandala M.; Giorli A.; Salerni L.; Fiorentino G.; Zucchi P.; Parravicini P.; Menatti E.; Baratti S.; Trotta T.; Giannattasio F.; Coiro G.; Lena F.; Coviello D.A.; Mussini C.; Renieri A.; Pinto A.M.
Adipocyte-derived extracellular vesicles regulate survival and function of pancreatic β cells 2021 Gesmundo I.; Pardini B.; Gargantini E.; Gamba G.; Birolo G.; Fanciulli A.; Banfi D.; Congiusta N.; Favaro E.; Deregibus M.C.; Togliatto G.; Zocaro G.; Brizzi M.F.; Luque R.M.; Castano J.P.; Bocchiotti M.A.; Arolfo S.; Bruno S.; Nano R.; Morino M.; Piemonti L.; Ong H.; Matullo G.; Falcon-Perez J.M.; Ghigo E.; Camussi G.; Granata R.
An antisymmetric neural network to predict free energy changes in protein variants 2021 Benevenuta S.; Pancotti C.; Fariselli P.; Birolo G.; Sanavia T.
Analysis of italian BRCA1/2 pathogenic variants identifies a private spectrum in the population from the Bergamo Province in northern Italy 2021 Figlioli G.; De Nicolo A.; Catucci I.; Manoukian S.; Peissel B.; Azzollini J.; Beltrami B.; Bonanni B.; Calvello M.; Bondavalli D.; Pasini B.; Lutati F.V.; Ogliara P.; Zuradelli M.; Pensotti V.; De Vecchi G.; Volorio S.; Verderio P.; Pizzamiglio S.; Matullo G.; Aneli S.; Birolo G.; Zanardi F.; Tondini C.; Zambelli A.; Livraghi L.; Franchi M.; Radice P.; Peterlongo P.
Artificial intelligence and statistical methods for stratification and prediction of progression in amyotrophic lateral sclerosis: A systematic review 2023 Tavazzi, Erica; Longato, Enrico; Vettoretti, Martina; Aidos, Helena; Trescato, Isotta; Roversi, Chiara; Martins, Andreia S; Castanho, Eduardo N; Branco, Ruben; Soares, Diogo F; Guazzo, Alessandro; Birolo, Giovanni; Pala, Daniele; Bosoni, Pietro; Chiò, Adriano; Manera, Umberto; de Carvalho, Mamede; Miranda, Bruno; Gromicho, Marta; Alves, Inês; Bellazzi, Riccardo; Dagliati, Arianna; Fariselli, Piero; Madeira, Sara C; Di Camillo, Barbara
BamToCov: An efficient toolkit for sequence coverage calculations 2022 Birolo G.; Telatin A.
Caucasian lean subjects with non-alcoholic fatty liver disease share long-term prognosis of non-lean: time for reappraisal of BMI-driven approach? 2022 Younes, Ramy; Govaere, Olivier; Petta, Salvatore; Miele, Luca; Tiniakos, Dina; Burt, Alastair; David, Ezio; Vecchio, Fabio Maria; Maggioni, Marco; Cabibi, Daniela; McLeod, Duncan; Pareja, Maria Jesus; Fracanzani, Anna Ludovica; Aller, Rocio; Rosso, Chiara; Ampuero, Javier; Gallego-Durán, Rocío; Armandi, Angelo; Caviglia, Gian Paolo; Zaki, Marco Y W; Liguori, Antonio; Francione, Paolo; Pennisi, Grazia; Grieco, Antonio; Birolo, Giovanni; Fariselli, Piero; Eslam, Mohammed; Valenti, Luca; George, Jacob; Romero-Gómez, Manuel; Anstee, Quentin Mark; Bugianesi, Elisabetta
Challenges in predicting stabilizing variations: An exploration 2023 Benevenuta S.; Birolo G.; Sanavia T.; Capriotti E.; Fariselli P.
Combined miRNA and SERS urine liquid biopsy for the point-of-care diagnosis and molecular stratification of bladder cancer 2022 Moisoiu T.; Dragomir M.P.; Iancu S.D.; Schallenberg S.; Birolo G.; Ferrero G.; Burghelea D.; Stefancu A.; Cozan R.G.; Licarete E.; Allione A.; Matullo G.; Iacob G.; Balint Z.; Badea R.I.; Naccarati A.; Horst D.; Pardini B.; Leopold N.; Elec F.
Dadaist2: A toolkit to automate and simplify statistical analysis and plotting of metabarcoding experiments 2021 Ansorge R.; Birolo G.; James S.A.; Telatin A.
DDGun: an untrained predictor of protein stability changes upon amino acid variants 2022 Montanucci L.; Capriotti E.; Birolo G.; Benevenuta S.; Pancotti C.; Lal D.; Fariselli P.
Deep learning methods to predict amyotrophic lateral sclerosis disease progression 2022 Pancotti C.; Birolo G.; Rollo C.; Sanavia T.; Di Camillo B.; Manera U.; Chio A.; Fariselli P.
Employing a systematic approach to biobanking and analyzing clinical and genetic data for advancing COVID-19 research 2021 Daga S.; Fallerini C.; Baldassarri M.; Fava F.; Valentino F.; Doddato G.; Benetti E.; Furini S.; Giliberti A.; Tita R.; Amitrano S.; Bruttini M.; Meloni I.; Pinto A.M.; Raimondi F.; Stella A.; Biscarini F.; Picchiotti N.; Gori M.; Pinoli P.; Ceri S.; Sanarico M.; Crawley F.P.; Birolo G.; Montagnani F.; Di Sarno L.; Tommasi A.; Palmieri M.; Croci S.; Emiliozzi A.; Fabbiani M.; Rossetti B.; Zanelli G.; Bergantini L.; D'Alessandro M.; Cameli P.; Bennet D.; Anedda F.; Marcantonio S.; Scolletta S.; Franchi F.; Mazzei M.A.; Guerrini S.; Conticini E.; Cantarini L.; Frediani B.; Tacconi D.; Spertilli C.; Feri M.; Donati A.; Scala R.; Guidelli L.; Spargi G.; Corridi M.; Nencioni C.; Croci L.; Caldarelli G.P.; Spagnesi M.; Piacentini P.; Bandini M.; Desanctis E.; Cappelli S.; Canaccini A.; Verzuri A.; Anemoli V.; Ognibene A.; Vaghi M.; D'Arminio Monforte A.; Merlini E.; Mondelli M.U.; Mantovani S.; Ludovisi S.; Girardis M.; Venturelli S.; Sita M.; Cossarizza A.; Antinori A.; Vergori A.; Rusconi S.; Siano M.; Gabrieli A.; Riva A.; Francisci D.; Schiaroli E.; Scotton P.G.; Andretta F.; Panese S.; Scaggiante R.; Gatti F.; Parisi S.G.; Castelli F.; Quiros-Roldan M.E.; Magro P.; Zanella I.; Della Monica M.; Piscopo C.; Capasso M.; Russo R.; Andolfo I.; Iolascon A.; Fiorentino G.; Carella M.; Castori M.; Merla G.; Aucella F.; Raggi P.; Marciano C.; Perna R.; Bassetti M.; Di Biagio A.; Sanguinetti M.; Masucci L.; Gabbi C.; Valente S.; Meloni I.; Mencarelli M.A.; Rizzo C.L.; Bargagli E.; Mandala M.; Giorli A.; Salerni L.; Zucchi P.; Parravicini P.; Menatti E.; Baratti S.; Trotta T.; Giannattasio F.; Coiro G.; Lena F.; Coviello D.A.; Mussini C.; Bosio G.; Mancarella S.; Tavecchia L.; Renieri A.; Mari F.; Frullanti E.
Extracellular vesicles derived from tumour cells as a trigger of energy crisis in the skeletal muscle 2022 Pin F.; Beltra M.; Garcia-Castillo L.; Pardini B.; Birolo G.; Matullo G.; Penna F.; Guttridge D.; Costelli P.
Extracellular vesicles miRNome profiling reveals a close liaison between circulating miRNAs and lipid metabolism derangements in patients with NAFLD 2022 Elisabetta Casalone, Gian Paolo Caviglia, Chiara Rosso, Serena Aneli, Alessandra Allione, Melania Gaggini, Cristina Grange, Fabrizia Carli, Angelo Armandi, Chiara Catalano, Giovanni Birolo, Davide Giuseppe Ribaldone, Amalia Gastaldelli, Elisabetta Bugianesi, Giuseppe Matullo
Functional and clinical implications of genetic structure in 1686 Italian exomes 2021 Birolo, Giovanni; Aneli, Serena; Di Gaetano, Cornelia; Cugliari, Giovanni; Russo, Alessia; Allione, Alessandra; Casalone, Elisabetta; Giorgio, Elisa; Paraboschi, Elvezia Maria; Ardissino, Diego; Duga, Stefano; Asselta, Rosanna; Matullo, Giuseppe
Genetic and epigenetic characterization of a discordant kmt2a/aff1-rearranged infant monozygotic twin pair 2021 Russo A.; Viberti C.; Mareschi K.; Casalone E.; Guarrera S.; Birolo G.; Cazzaniga G.; Corral L.; Trentin L.; Basso G.; Fagioli F.; Matullo G.
Identification of novel circulating microRNAs in advanced heart failure by next-generation sequencing 2021 Galluzzo A.; Gallo S.; Pardini B.; Birolo G.; Fariselli P.; Boretto P.; Vitacolonna A.; Peraldo-Neia C.; Spilinga M.; Volpe A.; Celentani D.; Pidello S.; Bonzano A.; Matullo G.; Giustetto C.; Bergerone S.; Crepaldi T.