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CREDO: a friendly Customizable, REproducible, DOcker file generator for bioinformatics applications 2024 Alessandri, Simone; Ratto, Maria L.; Rabellino, Sergio; Piacenti, Gabriele; Contaldo, Sandro Gepiro; Pernice, Simone; Beccuti, Marco; Calogero, Raffaele A.; Alessandri, Luca
A single cell RNAseq benchmark experiment embedding "controlled" cancer heterogeneity 2024 Arigoni, Maddalena; Ratto, Maria Luisa; Riccardo, Federica; Balmas, Elisa; Calogero, Lorenzo; Cordero, Francesca; Beccuti, Marco; Calogero, Raffaele A; Alessandri, Luca
Tamoxifen Activates Transcription Factor EB and Triggers Protective Autophagy in Breast Cancer Cells by Inducing Lysosomal Calcium Release: A Gateway to the Onset of Endocrine Resistance 2024 Boretto, Cecilia; Actis, Chiara; Faris, Pawan; Cordero, Francesca; Beccuti, Marco; Ferrero, Giulio; Muzio, Giuliana; Moccia, Francesco; Autelli, Riccardo
A novel machine-learning framework based on early embryo morphokinetics identifies a feature signature associated with blastocyst development 2024 Canosa, S.; Licheri, N.; Bergandi, L.; Gennarelli, G.; Paschero, C.; Beccuti, M.; Cimadomo, D.; Coticchio, G.; Rienzi, L.; Benedetto, C.; Cordero, F.; Revelli, A.
AI generativa (chatBot) in didattica 2023 Ivan Molineris, Leonardo Agasso, Ugo Ala, Beatrice Albanesi, Marco Beccuti, Marco Amato Cianci , Riccardo Casciaro , Franco Cauda , Riccardo Massimo Coda, Francesca Cordero, Luigi Di Caro , Ferdinando Di Cunto , Valerio Dimonte, Elena Mazzi , Gian Marco Mongiovi' , Gian Luca Pozzato, Luisa Tibiletti, Mariacristina Uberti , Erica Varese
MODIMO: Workshop on Multi-Omics Data Integration for Modelling Biological Systems 2023 Avesani S.; Bonnici V.; Pernice S.; Beccuti M.; Giugno R.
CONNECTOR, fitting and clustering of longitudinal data to reveal a new risk stratification system 2023 Pernice, Simone; Sirovich, Roberta; Grassi, Elena; Viviani, Marco; Ferri, Martina; Sassi, Francesco; Alessandrì, Luca; Tortarolo, Dora; Calogero, Raffaele A; Trusolino, Livio; Bertotti, Andrea; Beccuti, Marco; Olivero, Martina; Cordero, Francesca
A new computational workflow to guide personalized drug therapy 2023 Pernice, Simone; Maglione, Alessandro; Tortarolo, Dora; Sirovich, Roberta; Clerico, Marinella; Rolla, Simona; Beccuti, Marco; Cordero, Francesca
Artificial intelligence methods for biomedical imaging and omics data 2023 Barbano C.A.; Beccuti M.; Cordero F.; Ivanov D.N.; Licheri N.; Pernice S.; Presta A.; Renzulli R.; Grangetto M.
Bringing Cell Subpopulation Discovery on a Cloud-HPC Using rCASC and StreamFlow 2023 Contaldo S.G.; Alessandri L.; Colonnelli I.; Beccuti M.; Aldinucci M.
From compositional Petri Net modeling to macro and micro simulation by means of Stochastic Simulation and Agent-Based models 2023 Amparore, Elvio; Beccuti, Marco; Castagno, Paolo; Pernice, Simone; Franceschinis, Giuliana; Pennisi, Marzio
Single-Cell RNAseq Clustering 2023 Beccuti M.; Calogero R.A.
Stardust: improving spatial transcriptomics data analysis through space-aware modularity optimization-based clustering 2022 Avesani, Simone; Viesi, Eva; Alessandrì, Luca; Motterle, Giovanni; Bonnici, Vincenzo; Beccuti, Marco; Calogero, Raffaele; Giugno, Rosalba
An Agent-Based Model to Support Infection Control Strategies at School 2022 Baccega Daniele, Pernice Simone, Terna Pietro, Castagno Paolo, Moirano Giovenale, Richiardi Lorenzo, Sereno Matteo, Rabellino Sergio, Maule Milena, Beccuti Marco
An entropy heuristic to optimize decision diagrams for index-driven search in biological graph databases 2021 Licheri N.; Amparore E.; Bonnici V.; Giugno R.; Beccuti M.
Computational Analysis of circRNA Expression Data 2021 Ferrero G.; Licheri N.; De Bortoli M.; Calogero R.A.; Beccuti M.; Cordero F.
Multiformalism modeling and simulation of immune system mechanisms 2021 Amparore Elvio Gilberto; Beccuti Marco; Castagno Paolo; Franceschinis Giuliana; Pennisi Marzio; Pernice Simone;
Sparsely connected autoencoders: A multi‐purpose tool for single cell omics analysis 2021 Alessandri L.; Ratto M.L.; Contaldo S.G.; Beccuti M.; Cordero F.; Arigoni M.; Calogero R.A.
MODIMO: Workshop on Multi-Omics Data Integration for Modelling Biological Systems 2021 Beccuti M.; Bonnici V.; Giugno R.
GRAPES-DD: exploiting decision diagrams for index-driven search in biological graph databases 2021 Nicola Licheri, Vincenzo Bonnici, Marco Beccuti, Rosalba Giugno
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